Salah satu keunggulan ilmu pengetahuan saat ini adalah kita bisa mengikuti jejak pandemi COVID19 dengan cara yang belum pernah bisa diikuti oleh penyakit jenis ini sepanjang sejarah umat manusia, yang di sisi lain sudah dilanda pandemi dan bencana kesehatan terus menerus. Salah satu kemajuan yang memungkinkan kita tidak hanya mengetahui apa yang terjadi tetapi juga membuat prediksi tentang masa depan penyakit ini adalah kapasitas pengurutan yang sangat besar yang dimiliki umat manusia saat ini. Setiap bulan berbagai sampel di seluruh dunia diurutkan dan genomnya dibandingkan untuk melihat bagaimana virus berevolusi. Berkat ini dan akumulasi pengetahuan yang sangat besar tentang ini dan virus serupa lainnya, perkiraan dapat dibuat apakah SARS-CoVir2 menjadi lebih atau kurang agresif. Anda dapat membaca lebih lanjut tentang laju evolusi per mutasi di sini .
Dalam hal ini, salah satu hal yang mengejutkan para peneliti adalah rendahnya tingkat mutasi yang dimiliki virus tersebut . Sejak sampel SARS-Covir2 pertama diurutkan , 10.000 mutasi telah dikatalogkan di sekitar 71.000 sampel dari asal yang berbeda (per Juni 2020). Dari semuanya, tampaknya tidak ada yang memengaruhi peluang virus atau menjadi lebih mematikan, atau meningkatkan penularannya, menurut Pusat Pencegahan dan Pengendalian Penyakit Eropa , badan terkait Uni Eropa.
Virus mengubah urutannya setiap kali mereka bereplikasi, jutaan kali di setiap sel yang mereka infeksi
Mutasi yang diperoleh genom virus memiliki beberapa tujuan, seperti melacak infeksi . Individu dengan strain virus yang identik atau dengan hanya satu atau dua mutasi akan terinfeksi melalui rute yang sama seperti yang terinfeksi oleh strain dengan mutasi yang sangat berbeda. Dengan cara ini, diketahui bahwa kasus pertama yang terdeteksi di Seattle dan California berasal dari dua infeksi yang berbeda. Analisis urutan virus dari kedua pasien mengungkapkan bahwa masing-masing memiliki virus dengan mutasi pada posisi genom yang berbeda . Ini tidak berarti bahwa mereka memiliki virus yang berbeda atau bahwa virus akan bekerja secara berbeda pada satu pasien dan pasien lainnya. Sama seperti dua orang yang berbeda namun kita masih menganggap semua manusia sebagai bagian dari spesies yang sama.
Kegunaan lain dari pengurutan virus secara berkala adalah bahwa ini menunjukkan kepada kita daerah mana yang paling stabil dari genom virus – yang memiliki mutasi paling sedikit – dan yang paling bervariasi – yang paling banyak mengakumulasi mutasi . Ini penting untuk membuat vaksin yang bekerja dari waktu ke waktu melawan virus. Menggunakan daerah yang paling stabil -seperti spike protein S- sebagai target dalam vaksin akan mempersulit virus untuk mengubah target melalui mutasi dan vaksin kehilangan efektivitasnya.
Mutasi D614G terbaru ini , yang mendorong perubahan asam amino pada posisi 614 dari aspartat untuk glisin telah menimbulkan beberapa peringatan. Perbedaan mutasi ini yang membuatnya istimewa adalah ditemukan pada protein S , yang digunakan virus untuk berinteraksi dengan protein manusia ACE2 dan akibatnya memasuki sel-sel tubuh. Mutasi inilah yang tampaknya tersebar luas di seluruh dunia. Studi tentang efektivitas mutasi ini telah menunjukkan bahwa meskipun tidak terletak di domain pengikatan protein, tampaknya memungkinkan masuknya virus ke dalam sel dengan lebih efisien. Namun, data awal ini tampaknya tidak berdampak pada tingkat infeksi virus yang sebenarnya pada tingkat penularan penyakit. Demikian pula , tidak ada mutasi yang dijelaskan yang ditemukan memberikan keuntungan adaptif bagi virus .