Bagaimana dengan strain baru SARS-CoV-2?

Sekarang setelah kampanye vaksinasi terhadap virus corona yang menyebabkan pandemi COVID-19 dimulai, jenis baru yang muncul, atau terdeteksi untuk pertama kalinya, di negara Inggris itu muncul ke permukaan. Alarm telah melonjak dari pemerintah Inggris dan mereka telah mengomunikasikan bahwa strain baru dengan beberapa mutasi pada protein lonjakan virus mulai beredar dan telah terdeteksi di negara lain. Ini memiliki dua implikasi penting.

Di satu sisi, lonjakan adalah protein yang mengintervensi interaksi antara virus dan sel inang. Mutasi pada protein ini dapat mengubah efektivitas interaksi, seperti yang sebenarnya terjadi dalam kasus ini. Menurut sumber Inggris, mutasi ini menyebabkan virus menular 70% lebih banyak daripada strain biasa yang kita miliki sampai sekarang. Artinya jika sebelumnya setiap orang yang terinfeksi pada gilirannya menginfeksi orang lain, sekarang akan menginfeksi 1,7 orang. Secara epidemiologis, COVID-19 dianggap menyebar dengan laju 1,5 terinfeksi per pasien. Jadi jika kita menambahkan 70%, pasien dengan jenis ini lebih mungkin menginfeksi hingga 2,55 orang. Perkiraannya adalah 1,5 orang yang terinfeksi strain sebelumnya ditambah 70% dari 1,5 ini yaitu 1,05. Ini sudah merupakan tantangan baru bagi kesehatan global. Meskipun penelitian yang dilakukan dalam hal ini tidak menunjukkan bahwa meskipun menyebar lebih cepat, tingkat kematiannya bervariasi, meskipun harus dikatakan bahwa menginfeksi lebih banyak orang akan meningkatkan angka kematian, bukan karena virus yang lebih berbahaya tetapi karena jumlah yang terinfeksi lebih banyak.

Di sisi lain, protein lonjakan adalah target pilihan vaksin yang sedang dikembangkan untuk melawan virus. Dengan bermutasi wilayah ini, ada kemungkinan target materi genetik yang ditandai oleh vaksin telah hilang atau berubah dan sudah dapat dikenali. Untuk saat ini tampaknya tidak ada vaksin yang kehilangan kemanjurannya karena mutasi ini, meskipun tes langsung belum dilakukan untuk menguatkan indikasi ini di atas kertas.

Strain b.1.17 memiliki mutasi ganda, atau lebih tepatnya harus dikatakan bahwa kluster strain SARS-CoV-2 yang kita sebut b.1.17 atau VUI-202012/01 memiliki mutasi di berbagai lokasi. Secara khusus, dalam lonjakan kami menemukan penghapusan basa berikut pada posisi 69-70, juga pada posisi 144, dan perubahan basa berikut yang memengaruhi asam amino N501Y, A570D, D614G, P681H, T716I, S982A, D1118H. Nomenklatur ini mengacu pada nukleotida yang diubah di depan, posisi di tengah dan kemudian huruf asam amino yang dihasilkan dari mutasi. Dari semuanya, mutasi yang paling penting adalah pada posisi 501, perubahan tersebut menghasilkan variasi pada protein spike yang mengubah kemampuan untuk berikatan dengan reseptor masuk, yaitu protein ACE2 . Mutasi ini memiliki efek yang mirip dengan mutasi lain yang terletak di wilayah 614, yang juga mengubah kemampuan virus untuk berinteraksi dengan ACE2. Mutasi ini sangat sering terjadi pada galur lain, seperti pada galur mayoritas di selatan benua Amerika.