Messenger RNA adalah RNA untai tunggal yang terbentuk selama proses transkripsi dari DNA ke RNA . Agar RNA polimerase terbentuk, ia harus mengikat DNA dibantu oleh kofaktor transkripsi . Proses transkripsi terjadi di nukleus pada eukariota dan di sitoplasma pada prokariota .
Skema sederhana dari struktur utama messenger RNA
RNA ini disebut pembawa pesan karena membawa pesan dari DNA ke pembentukan protein . Messenger RNA, disederhanakan sebagai mRNA atau mRNA, berjalan dari DNA ke ribosom , kompleks riboprotein yang akan menerjemahkannya menjadi protein.
Semua mRNA, baik eukariotik maupun prokariotik, membawa urutan pada ujung ke-3 yang mencegah degradasi awal di sitoplasma. Urutan ini biasanya poliadenilasi (ekor dari beberapa basa diikuti oleh adenin, sering disebut poliA ). Pada ujung 3 mRNA biasanya terdapat sinyal pengenalan poliadenilasi. Urutan ( AAUAAA ) yang menarik mesin untuk menambahkan ekor poliA ke mRNA.
Perlu dicatat bahwa ekor poliA ini tidak dikodekan dalam DNA , tetapi ditambahkan kemudian. Dengan mengingat data ini, gen telah ditemukan yang telah diperkenalkan kembali dari mRNA ke DNA melalui proses transkripsi terbalik . Gen – gen ini pada akhirnya mengandung ekor poliT , basa komplementer adenin. Dalam beberapa penelitian yang menarik untuk mengisolasi transkriptom (semua mRNA sel atau jaringan), mereka dapat diisolasi dengan memanfaatkan ekor poliA untuk membedakannya dari RNA lain .
Di sisi berlawanan dari mRNA, ujung 5 , tutup ( CAP ) ditambahkan selama transkripsi , yang merupakan guanin yang dimodifikasi menjadi 7-metilguanosin trifosfat . CAP meningkat , seperti ekor poliA, waktu paruh mRNA dalam sitoplasma. Selain itu, guanin ini dikenali oleh ribosom yang akan bertanggung jawab untuk mengikat mRNA dan memediasi translasi menjadi protein.
Selain proses ini, selain transkripsi , mRNA eukariotik mengalami proses pematangan . Dalam hal ini, urutan aksesori , atau ekson , dieliminasi , menghasilkan protein yang berbeda, dengan penyambungan . Basa nitrogen dalam urutan juga dapat diubah dan mRNA dapat dimodifikasi untuk memvariasikan ekspresinya . Semua proses pematangan ini disebut regulasi pasca-transkripsi , ekspresi protein dikontrol sebelum menghasilkannya. Sebagian besar modifikasi ini dilakukan dalam inti sel eukariotik, meskipun modifikasi kecil dapat dilakukan di sitoplasma sebelum translasi. Seperti yang telah kita lihat, memperpanjang waktu paruh mRNA adalah penting. mRNA adalah rantai sederhana asam nukleat, ini dalam sel dapat dianggap sebagai masalah, karena sebagai metode pertahanan terhadap organisme lain, sebagian besar sel mendegradasi semua asam nukleat beruntai tunggal dengan ribonuklease . Tanpa perlindungan ujung 3 ‘dan 5’ mRNA, mekanisme pertahanan sel itu sendiri akan mengenalinya sebagai bahaya.
Akhirnya, perlu dicatat bahwa semua mRNA eukariotik adalah monokistronik , yaitu, mereka memiliki asal terjemahan tunggal . Hanya ada satu urutan inisiasi translasi, selalu metionin . Namun mRNA prokariotik adalah polikistronik . The sama mRNA dapat memiliki beberapa urutan inisiasi translasi pada rantai yang sama. Akan ada beberapa metionin yang dapat menimbulkan protein yang berbeda, terkadang mereka berada dalam kerangka baca yang berbeda .