Seperti yang kita ketahui, kingdom ini mencakup semua organisme prokariotik, meskipun beberapa penulis sebenarnya mempertimbangkan keberadaan dua kingdom yang berbeda (atau domain – kategori taksonomi orde tinggi): Archaea dan Bakteri. Bagaimanapun, dalam artikel ini kami akan memperlakukan kedua kelompok secara tidak jelas.
Archaebacteria dibedakan oleh karakteristik molekuler dan metabolisme dan sensitivitas yang berbeda terhadap agen antimikroba tertentu (berasal dari perbedaan komposisi dinding dan membran plasma). Perbedaan yang paling signifikan adalah bahwa dindingnya tidak pernah mengandung murein dan bahwa membran sel mengandung lipid yang berbeda dari jenis sel lainnya. Selanjutnya, urutan nukleotida dari RNA transfer dan RNA ribosom berbeda dari semua organisme lain. Mereka tidak menggunakan Siklus Calvin untuk mereduksi CO2 dan memasukkan metionin sebagai asam amino pertama dalam sintesis protein (tidak seperti sel eubakteri dan eukariotik). Lebih jauh lagi, kebanyakan adalah ekstrofil, mereka hidup di lingkungan dengan kondisi ekstrim (panas, tekanan, keasaman atau salinitas yang sangat berbeda dengan kondisi biasa makhluk hidup lainnya).
The Eubacteria dikelompokkan kebanyakan bakteri, yang organisasinya berkorespondensi ke sel prokariotik khas.
Anabaena, sebuah cyanobacterium
Kelompok utamanya adalah sebagai berikut:
Bakteri hijau: Mengandung bakterioklorofil. Hijau dengan belerang adalah anaerob yang menggunakan H2S dalam fotosintesis anoksigeniknya dan hidup dalam lumpur. Sayuran bebas sulfur menggunakan zat organik untuk fotosintesis anoksigeniknya. Contoh: Klorobium .
Bakteri ungu: Dengan bacteriochlorophyll. Thiobacteria ungu menggunakan H2S dalam fotosintesis anoksigeniknya dan mengakumulasi belerang di bagian dalamnya, di sumber belerang, dan perairan rawa. Ungu bebas sulfur menggunakan hidrogen organik untuk fotosintesis dan fotosintetik fakultatif, kemiosintetik, atau saprofit. Bentuk terkait lainnya kekurangan pigmen dan heterotrofik, dan mungkin atau mungkin tidak parasit. Beberapa fermentatif menonjol. Contoh: Pseudomonas .
Spirochetes : Cirinya, bentuknya memanjang dan spiral. Saprofit di perairan tawar atau asin, dan ada juga yang bersifat patogen seperti T. pallidum , yang menyebabkan sifilis.
Cyanobacteria : Mereka mengandung klorofil a dan phycocyanin (yang memberi warna biru-hijau) dan pigmen lainnya. Oksigen fotosintetik, beberapa memperbaiki nitrogen atmosfer. Mereka dapat membentuk koloni berfilamen. Mereka hidup di air dengan sedikit persyaratan. Contoh: Nostoc .
Actinobacteria : Mereka adalah Gram +, yang dianggap sebagai jamur karena beberapa memiliki miselium yang berkembang dan menghasilkan spora sebagai bentuk resistensi. Kebanyakan dari mereka tidak bergerak, saprofit, hidup di tanah, di lumpur, di pupuk kandang, di susu, dll. Lainnya adalah parasit. Banyak spesies menghasilkan antibiotik. Contoh: Streptomyces .
Bakteri pembentuk endospora : Sebagian besar adalah Gram +, bakteri aerob obligat atau fakultatif. Mereka memiliki kesamaan kemampuan untuk membentuk endospora; banyak menghasilkan antibiotik dan dapat mencerna pati, pektin, dan selulosa. Mereka didistribusikan oleh banyak habitat di seluruh biosfer. Contoh: Bacillus .
Bakteri laktat : Mereka anaerobik, tetapi toleran terhadap oksigen. Sangat penting untuk bertanggung jawab atas fermentasi laktat. Contoh: Lactobacillus .
Afragmobacteria : Mereka adalah bakteri terkecil, tanpa dinding sel, tetapi dengan membran yang dibentuk oleh tiga lapisan yang mengandung sejumlah besar kolesterol. Ada parasit dan patogen pada saluran pernapasan dan urogenital. Contoh: Mycoplasma .
Mixobaterias : Mereka merupakan bentuk multiseluler yang tampaknya berperilaku sebagai organisme tunggal. Individu adalah batang Gram – terbungkus massa lendir yang mereka buat. Mereka berlimpah di tanah. Contoh: Myxococcus .