hipolitik
Komunitas bakteri hipolitik, yang hidup di bawah batu, telah dipelajari kurang ekstensif dibandingkan cyanobacteria fotosintesis, yang mendominasi ekosistem ini. Faktor abiotik yang menentukan komposisi dan aktivitas komunitas bakteri hipolitik adalah air cair yang berasal dari hujan dan kabut, serta salinitas. Studi yang dilakukan di gurun Atacama, Chili, menunjukkan bahwa baik tanah dan heterotrof hipolitik berkorelasi positif dengan kelembaban tanah dari curah hujan dan karena itu lebih melimpah di lokasi terbasah sepanjang gradien presipitasi 11.500 m2. Berdasarkan analisis keragaman urutan 16S rRNA, komunitas hipolitik, tidak seperti komunitas tanah, terutama terdiri dari Acidobacteria, alfa, beta dan gamma, subkelas Proteobacteria dan diekstraksi bersama dengan kolonisasi cyanobacteria.
Studi yang dilakukan dengan sampel yang dikumpulkan di gurun Namibia, yang meliputi pantai Atlantik Angola, Namibia, dan Afrika Selatan, menunjukkan bahwa kelembaban hujan memiliki efek yang berbeda pada tanah dan komunitas hipolitik daripada kelembaban kabut… Sejumlah besar Unit Taksonomi Operasional yang berasal dari polimorfisme panjang restriksi terminal dari gen 16S rRNA diamati di komunitas hipolitik situs yang didominasi hujan daripada di situs yang didominasi kabut. Sebaliknya, komunitas tanah tidak dipengaruhi oleh iklim karena mereka memiliki jumlah unit taksonomi operasional yang sama di kedua rezim.
Kerak gurun
Komunitas bakteri heterotrofik wajib adalah komponen penting dari konsorsium organisme yang membentuk kerak gurun. Kolonisasinya di keropeng diikuti oleh perintis cyanobacteria, yang merupakan produsen dominan utama yang berkontribusi pada fiksasi nitrogen dan karbon. Investigasi pola spasial komunitas bakteri heterotrofik pada skala mikro mengungkapkan distribusi yang bergantung pada kematangan keropeng. Dalam kerak gurun pionir di Dataran Tinggi Colorado, komunitas paling melimpah di bawah permukaan langsung (1 hingga 2 mm), sedangkan pada kerak berpigmen yang lebih berkembang, kelimpahan tertinggi diamati di permukaan (0 hingga 1 mm).
Tekstur tanah kerak gurun juga merupakan faktor penentu dalam jumlah total mikroorganisme yang dapat mereka dukung. Jumlah terendah ditemukan di kerak terbuka atau padat dan di tanah tanpa kerak diikuti oleh kerak permukaan lanau. Kerak tanah liat mendukung jumlah bakteri tertinggi karena kemampuannya untuk mempertahankan lebih banyak kelembaban dan bahan organik di dalam ruang pori di mana kehidupan mikroba ada.
Analisis filogenetik menggunakan metode kultur-independen menunjukkan bahwa sebagian besar urutan 16S rRNA yang diperkuat dari tanah kerak gurun milik cyanobacteria. Dalam kasus di mana sampel korteks berasal dari situs hiper-kering, mereka membentuk hingga 80% dari total komunitas yang diurutkan.