Penyambungan alternatif atau pengocokan ekson adalah mekanisme molekuler penyuntingan pasca-transkripsi di mana beberapa mRNA (messenger RNA, salah satu yang akan diterjemahkan menjadi protein) diperoleh dari sekuens DNA tunggal yang telah ditranskripsi menjadi transkrip utama mRNA. Fenomena splicing alternatif pada dasarnya eukariotik . The bakteri dan virus dapat menyajikan jenis pengobatan untuk RNA, tetapi jauh kurang umum . Sementara bakteri dan virus biasanya memiliki gen yang tumpang tindih untuk menyimpan DNA mereka, eukariota telah memilih untuk penyambungan, untuk menemukan sejumlah gen, lebih banyak protein, menjungkirbalikkan dogma biologi gen protein . Penyambungan alternatif meskipun lebih disukai eukariotik tidak bertanggung jawab atas kompleksitas organisme ini, melainkan merupakan konsekuensinya.
Cara splicing alternatif a) penghilangan / penyertaan ekson, b) alternatif 3 (situs poliA berbeda) c) promotor berbeda dan d) retensi intron
Penyambungan alternatif mengacu pada alternatif yang dimiliki RNA melalui penyambungan, yang merupakan penghapusan urutan spesifik dari rantai RNA. Dengan cara ini, dengan reorganisasi atau eliminasi fragmen mRNA, protein dengan fungsi atau tempat aksi yang berbeda dapat diterjemahkan , yang akan disebut isoform dari protein yang sama. Isoform yang diperoleh dengan cara ini atau cara lain biasanya dibedakan dengan huruf Yunani setelah namanya.
Dalam DNA yang mengkode protein, kita menemukan dua jenis urutan, intron dan ekson. Yang pertama adalah sekuens intergenik yang tidak akan diterjemahkan menjadi protein, yaitu akan dihilangkan dengan penyambungan “konvensional”. Untuk mempelajari lebih lanjut tentang intron atau jenis penyambungan yang dimiliki setiap jenis intron, Anda dapat membaca artikel yang kami buat. mendedikasikan untuk itu. disini . Ekson di sisi lain akan menjadi urutan yang akan diterjemahkan menjadi protein, untuk mempelajari lebih lanjut tentang mereka Anda dapat melihat artikel yang kami persembahkan untuk mereka di sini .
Ekson tidak diatur ulang secara acak, tetapi penyambungan sangat terkontrol sehingga tidak ada protein yang berbahaya bagi individu yang muncul.
Jenis penyambungan alternatif:
Kasus paling sederhana adalah penyambungan ekson , di mana sebuah ekson dihilangkan bersama dengan dua urutan intronik yang berdekatan.
Kemungkinan lain adalah bahwa intron tidak dihilangkan , dan diterjemahkan menjadi protein, dengan kemungkinan mengkodekan kodon stop atau mengubah kerangka baca untai RNA.
Seleksi promotor : satu gen berada di bawah pengaruh dua promotor (urutan RNA polimerase yang mengikat untuk membentuk mRNA) dan tergantung pada keadaan, satu promotor atau yang lain akan diaktifkan, sehingga menimbulkan ujung N-terminal yang berbeda.
Pemilihan situs poliadenilasi : Urutan mRNA memiliki dua urutan yang menandakan penambahan ekor dari berbagai adenin, yang disebut ekor poliA . Ekor ini yang menyajikan 70% dari mRNA yang digunakan untuk menandai mRNA untuk terjemahannya menjadi protein dan tergantung pada urutan mana yang diaktifkan, satu protein atau lainnya akan diproduksi.
Fenomena alternatif splicing juga dapat menyebabkan rekombinasi antara ekson gen yang berbeda, dalam hal ini disebut trans-splicing .