siRNA

Dengan siRNA, RNA pengganggu kecil (RNA inferensi kecil) diketahui. Jenis RNA untai ganda ini baru-baru ini ditemukan, pada tahun 2006 Craig C. Mello dan Andrew Fire dianugerahi Hadiah Nobel dalam Fisiologi dan Kedokteran untuk penemuan jalur yang digunakan oleh RNA kecil ini untuk mengganggu regulasi gen. Namun, sebagian besar operasinya masih belum ditemukan. Itulah sebabnya siRNA saat ini berada di puncak gelombang penelitian pembungkaman gen.

Skema pembungkaman gen yang dihasilkan oleh siRNA dan kompleks RISC

SiRNA dapat berasal dari endogen atau lebih sering berasal dari eksogen . Sebagian besar siRNA yang dipelajari berasal dari beberapa patogen, terutama virus, baik dari tumbuhan maupun hewan. Namun, mereka kadang-kadang dapat dikodekan oleh organisme itu sendiri; misalnya dalam urutan berulang tandem.

Terlepas dari asalnya, siRNA terbentuk dari RNA untai tunggal yang bertindak sebagai templat untuk polimerase yang bergantung pada RNA , RDRP (RNA polimerase yang bergantung pada RNA). Polimerase ini mengikat molekul RNA untai tunggal, ssRNA (dari RNA untai tunggal bahasa Inggris) dan mensintesis untai komplementer, membentuk RNA untai ganda , disingkat dsRNA (RNA untai ganda). Harus diingat bahwa ada virus dsRNA yang dapat bertindak langsung tanpa memerlukan RDRP. Bagaimanapun, beberapa siRNA disintesis dari RNA untai ganda yang relatif panjang, meskipun tidak semua bagian yang dihasilkan dari pembelahan adalah siRNA fungsional. dsRNA panjang dipotong oleh enzim yang disebut Dicer , protein sitoplasma dari keluarga RNA III (keluarga enzim yang fungsinya untuk memotong RNA). Potongan dsRNA yang dihasilkan, dan siRNA, berukuran antara 20 dan 25 nukleotida dengan gugus fosfat di ujung 5 dan gugus hidroksil di ujung 3. The negatif atau anti-akal untai akan menjadi salah satu yang dirakit di protein kompleks yang disebut RISC dan yang nantinya akan dipasangkan dengan homologi dasar dengan mRNA. Homologi antara siRNA dan mRNA sangat tinggi , karena hanya 4 dari 25 nukleotida yang bisa non-homolog.

Pusat aktif kompleks ribo-protein besar RISC adalah protein tipe Argonaut (biasanya disingkat AGO dalam literatur ilmiah), dengan kapasitas endonuklease, yang memotong untaian mRNA pada titik perantara rantai. Potongan yang dihasilkan dapat didegradasi oleh mesin seluler normal. Baru-baru ini diusulkan bahwa potongan mRNA yang dipotong oleh AGO dapat menjadi bagian dari kumpulan siRNA setelah diproses oleh RDRP baru, berbeda dari yang pertama.

Berkat siRNA, ekspresi gen ditekan oleh degradasi mRNA mereka. Selanjutnya, siRNA telah digambarkan sebagai peserta dalam organisasi kromatin. Saat ini, banyak interaksi virus-host sedang dipelajari karena siRNA telah dijelaskan dalam berbagai rute pertahanan melawan virus dan sebagai bentuk serangan virus. Selama proses infeksi virus, kedua belah pihak memproses atau mensintesis RNA untuk mendapatkan siRNA yang membungkam pertahanan atau protein virus.

Penemuannya tidak hanya memungkinkan pemahaman yang lebih baik tentang interaksi virus-host, tetapi juga menjadi alat laboratorium yang sangat baik. Pembungkaman SiRNA telah terbukti menjadi alternatif yang sangat baik untuk individu yang bermutasi genom untuk studi ilmiah tentang fungsi protein. Memungkinkan untuk menghambat atau menurunkan ekspresi protein tanpa perlu melakukan mutagenisasi. Setiap hari beberapa modulasi ekspresi oleh siRNA dalam proses yang sudah diketahui dijelaskan, memberikan dimensi baru pada proses yang diyakini dipelajari dengan sangat baik.

Related Posts