Protein bertanggung jawab di dalam sel untuk melakukan proses apa pun. Untuk melakukan ini, protein harus melipat dan membuat pusat aktif. Sejak mereka meninggalkan retikulum endoplasma (ER), di mana mereka diterjemahkan dari RNA ke protein, sampai protein mulai berfungsi, mereka mengalami perubahan konformasi dan lipat untuk mengadopsi karakteristik fisik dan kimia yang memungkinkan mereka untuk berinteraksi dengan protein lain, lipid. atau karbohidrat.. Anda dapat membaca lebih lanjut tentang terjemahan RNA menjadi protein dalam artikel yang kami persembahkan di sini . Anda juga dapat membaca tentang kode terjemahan RNA-ke-protein universal yang digunakan oleh eukariota di sini .
Rantai asam amino diwakili dengan ekornya
Pola yang berbeda dari protein telah diklasifikasikan ke dalam empat fase penataan. The struktur primer adalah dasar dari tiga struktur lain yang protein mengadopsi. Semua protein memiliki struktur primer, sekunder, dan tersier . Struktur sekunder dan tersier terkait dengan konformasi tiga dimensi protein . Sedangkan struktur kuartener berkaitan dengan modifikasi yang dialami suatu protein ketika berinteraksi dengan yang lain. Anda dapat membaca lebih lanjut tentang struktur sekunder dalam artikel yang kami persembahkan di sini , tentang struktur tersier di sini dan struktur kuartener protein yang kami bahas dalam artikel di sini .
The struktur primer adalah yang paling dasar dari semua . Ini didefinisikan sebagai rantai asam amino yang membentuk protein segera setelah meninggalkan RE. Dua faktor campur tangan dalam struktur primer, jumlah asam amino yang membentuk rantai dan urutannya .
Sebagian besar protein terdiri dari rantai antara 50 dan 300 asam amino , meskipun ada protein yang melebihi 1.000 asam amino. Struktur primernya linier, tidak bercabang , di belakang setiap asam amino hanya satu yang bergabung pada satu waktu. Tentu saja, asam amino itu sendiri tidak selalu linier dan beberapa memiliki ekor yang menonjol dari rantai linier , yang nantinya akan bertugas untuk berinteraksi dengan asam amino lain, tetapi itu adalah cerita lain.
Penyatuan antara asam amino dilakukan oleh ikatan kovalen , yang merupakan energi tertinggi dan karena itu sangat resisten. Ikatan antara asam amino dikenal sebagai ikatan peptida . Mereka adalah interaksi antara ujung karboksil dan ujung amino dari asam amino berikutnya . Di RE, rantai peptida disintesis dalam arah dari ujung amino menuju karboksil dan oleh karena itu merupakan arah pembacaan rantai asam amino berdasarkan kesepakatan.
Manusia, dan sebagian besar makhluk hidup menggunakan sejumlah asam amino yang berbeda . Beberapa spesies mampu mensintesis asam amino yang berbeda, tetapi mereka adalah minoritas. Oleh karena itu, rantai asam amino memiliki kemungkinan kombinasi tak terhingga (mereka adalah kombinasi dari 20 unsur yang diambil dari n ke n ). Setelah translasi, rantai asam amino dapat dimodifikasi (modifikasi pasca-translasi ) dan dilakukan oleh fosforilasi, metilasi, asetilasi, hidroksilasi , dll. yang akan menyebabkan mereka berperilaku berbeda.
Struktur primer dapat memberi kita gagasan tentang domain yang akan terbentuk ketika protein terlipat dan oleh karena itu dapat memberi kita indikasi lokasi , fungsinya atau dengan siapa protein dapat berinteraksi. Pada banyak kesempatan, rantai asam amino digunakan untuk membandingkan protein dan membangun hubungan filogenetik antara spesies yang jauh , karena rantai asam amino secara evolusi lebih stabil daripada RNA , di mana ada beberapa kembar tiga yang mengkode asam amino yang sama..