Meskipun anak berusia tiga tahun dapat dengan mudah menjawab jika ditanya apakah buaya adalah burung, studi genetik yang dilakukan dan akibatnya ahli zoologi yang berspesialisasi dalam bidang ini dapat menemukan beberapa perdebatan dalam hal ini. Pertanyaan yang tidak menimbulkan keraguan bagi para naturopat dan ahli zoologi yang mulai mengurutkan makhluk hidup dalam taksa yang berbeda, muncul ketika sejarah evolusi berbagai kelompok yang bersangkutan dipelajari secara mendalam, anatomi mereka dianalisis dan di atas semua itu dimulai. DNA yang akan digunakan untuk menentukan hubungan evolusioner.
Saat ini tidak ada keraguan tentang fakta evolusi pemisahan mamalia dan burung dari reptil. Reptil, sebagai nenek moyang evolusioner burung, memiliki kesamaan kunci tertentu. Akan tetapi, perbedaan antara satu kelompok dengan kelompok lainnya sangat tipis. Di sisi lain, mengherankan bahwa budaya populer mampu memasangkan ular, kura-kura dan buaya sebelumnya, daripada yang terakhir dengan elang.
Sauropsida (urutan tetrapoda yang disebut Sauropsida) termasuk yang disebut reptil dan burung. Sebelumnya tetrapoda termasuk kelas Reptilia (kadal terkenal, ular, kura-kura dan buaya) dan burung secara terpisah. Hari ini kita tahu bahwa hubungan evolusioner mereka jauh lebih dekat daripada yang diperkirakan sebelumnya. Tes DNA menunjukkan bahwa kelompok-kelompok ini memang terkait, menguatkan bukti fosil yang menunjukkan dinosaurus berbulu dan mengadopsi postur bipedal khas burung, serta karakteristik lain seperti paruh. Untuk bagian mereka, burung mempertahankan sisa-sisa masa lalu saurian mereka, kaki cakar bersisik mereka adalah contoh terbaik dari ini.
Anehnya, posisi kura-kura dalam silsilah keluarga reptil juga kontroversial, meskipun sebagian besar penelitian lebih mengaitkan mereka dengan buaya dan burung daripada ular dan kadal. Dua anggota terakhir dari kelompok reptil ini secara evolusioner paling terkait, membentuk lepisinurus. Secara keseluruhan, reptil dan burung dianggap diapsid, karena secara evolusi mereka memiliki dua fossa tengkorak di belakang mata.
Jika tes DNA tidak cukup bagi Anda untuk percaya bahwa buaya lebih mirip dengan burung (mereka memiliki nenek moyang evolusi yang lebih dekat daripada reptil lainnya) berikut adalah karakteristik yang dimiliki buaya dan burung, tidak termasuk reptil lainnya:
Pertama-tama, keduanya memiliki jantung empat bilik, mirip dengan mamalia, sedangkan kadal, kura-kura, dan ular hanya memiliki 3 bilik. Dalam sistem pencernaan, perut memiliki dua ruang, yang memungkinkan mereka mencerna dengan sangat mirip. Respirasi burung bekerja dalam satu arah saja, berkat tiga ruang pernapasan, dengan cara ini mereka dapat menjaga paru-paru mereka selalu teroksigenasi. Bentuk pinggul, kunci untuk menentukan reptil dengan sisipan kaki, sama antara burung dan buaya dan berbeda dari sauropsida lainnya. Akhirnya, buaya di dalam reptil adalah yang memiliki perilaku yang lebih berkembang dalam merawat anak-anak, mirip dengan burung.