Bahwa kita tahu sebagian kecil dari bakteri yang ada adalah fakta yang dibagikan oleh seluruh komunitas penelitian. Diperkirakan kita mengetahui kurang dari 1% bakteri. Jika untuk ini kita harus menambahkan bahwa dari waktu ke waktu kita menemukan bakteri prasejarah yang diselamatkan dari parit laut, es Arktik atau, seperti pada kesempatan ini, usus nenek moyang manusia… Nah, ternyata daftar bakteri tidak terbatas.
Sebuah studi baru-baru ini menunjukkan bahwa keragaman flora usus manusia leluhur jauh lebih beragam daripada manusia cararn. Ini mungkin karena fakta bahwa makanan kita jauh lebih aman dan “monoton” daripada sebelumnya atau karena evolusi flora telah mendukung kemenangan akhir beberapa spesies tertentu. Dalam hal ini, semakin banyak poin yang mendukung koevolusi antara manusia dan jutaan mikroorganisme yang hidup di dalam tubuh. Misalnya, ada indikasi bahwa virus mungkin berada di balik kejadian penyakit celiac tertentu . Pada kenyataannya kita hanya tahu sedikit tentang komunitas bakteri yang hidup di dalam diri kita, tetapi ketika kita mengungkapkan lebih banyak tentang mereka, semakin terbukti bahwa mereka memiliki efek yang lebih besar dari yang diharapkan tidak hanya pada pencernaan makanan tetapi juga pada perlindungan terhadap penyakit seperti kanker atau diabetes .
Studi yang diterbitkan di Nature membandingkan bakteri yang ditemukan dalam fosil feses berusia 1.000 dan 2.000 tahun dari wilayah Amerika Utara dengan berbagai populasi saat ini, beberapa yang masih memiliki gaya hidup pemburu-pengumpul dan populasi perkotaan cararn lainnya. Dalam hal ini sampel penduduk kota jauh lebih sedikit daripada dua sampel lainnya. Diet berdasarkan makanan olahan dan sedikit produk liar dan liar tampaknya penting dalam berbagai mikroorganisme di usus.
Meskipun sisa-sisa berusia 2.000 tahun sangat mirip dengan yang sekarang, kenyataannya adalah bahwa lebih dari 60 genom yang tidak diketahui telah ditemukan sejauh ini. Genom ini menanggapi spesies yang tidak diketahui ceincia cararn. Lebih khusus, dan tidak mengejutkan, bakteri primitif tidak mengandung gen resistensi antibiotik, yang hadir dalam kotoran manusia dunia pertama. Di antara gen-gen yang telah ditemukan dalam genom purba, keragaman gen yang didedikasikan untuk fleksibilitas evolusi sangat mengejutkan. Pemukim pertama usus itu memiliki kapasitas besar untuk memvariasikan DNA mereka, mungkin untuk beradaptasi dengan perubahan kondisi konsumsi manusia. Sebaliknya, manusia cararn dan pola makan mereka yang stabil telah menghasilkan fiksasi gen dan stabilisasi spesies flora usus yang lebih efektif.
Hilangnya spesies yang tidak diketahui ini bisa jadi berada di balik peningkatan penyakit autoimun terkait usus yang telah ditemukan dalam beberapa abad terakhir. Tetapi kurangnya gen untuk enzim yang mendegradasi mukosa usus juga terlihat, yang juga terkait dengan penyakit. Kita tidak tahu apakah flora usus purba lebih efisien atau lebih terlindungi dari berbagai penyakit, apa yang kita ketahui adalah bahwa saat ini penyakit yang berhubungan dengan flora usus semakin penting dalam masyarakat kita dan mungkin kunci untuk memecahkan masalah ini ditemukan dalam fosil feses. pemburu-pengumpul berusia 2.000 tahun.