Mikrobiota adalah kumpulan makhluk mikroskopis yang hidup di permukaan luar atau dalam tubuh makhluk multiseluler besar, hewan, dan tumbuhan. Di antara hewan, mikrobiota, kadang-kadang disebut sebagai flora, sangat bervariasi. Tergantung pada spesies hewan, populasi, diet, kondisi iklim, dll. mikroorganisme yang menghuni kulit dan mukosa individu dapat bervariasi. Juga selama kehidupan organisme, mikrobiota dapat bervariasi beradaptasi dengan diet baru -seperti halnya mereka yang meninggalkan menyusui-. Baca lebih lanjut tentang mikrobiota secara umum di sini (segera hadir). Secara umum, pada manusia, 5 biota utama yang menutupi mukosa – oral, vagina, usus, okular – dan kulit telah dipelajari secara mendalam. Yang paling terkenal dari semuanya, dan sangat terkait dengan mikrobiota mulut, adalah mikrobiota usus, yang dapat Anda baca lebih lanjut di sini .
Mulut adalah salah satu tempat paling sering kita dapat menemukan bakteri. Meskipun benar bahwa banyak produk kebersihan mulut memastikan eliminasi bakteri dengan persentase keberhasilan yang tinggi, kenyataannya bakteri terus menjajah mulut kita dan sebagian besar merupakan habitat alami mereka. Sementara beberapa bakteri dapat berbahaya bagi kesehatan, lihat penyebab gigi berlubang, yang lain adalah bagian dari kesehatan mulut yang paling dasar.
Bakteri terus-menerus menjajah mulut, bukan hanya karena kita menelannya dengan makanan atau menghilangkannya saat kita menyikat gigi. Tetapi mereka juga mencegah bakteri lain. Sebuah penelitian baru-baru ini menunjukkan bahwa spesies bakteri yang berbeda secara khusus menjajah berbagai daerah lidah. Wilayah didistribusikan tergantung pada kondisi yang paling optimal untuk masing-masing spesies atau digantikan oleh spesies lain yang memiliki efisiensi lebih besar. Hasilnya menunjukkan interaksi yang tinggi antara komunitas-komunitas ini yang terstruktur dengan sangat tepat di berbagai wilayah bahasa.
Streptococcus mutans merupakan salah satu bakteri penyebab gigi berlubang. Jelas itu terutama ditemukan di gigi, tetapi juga dengan kedekatan itu menjajah tepi luar lidah. Bakteri dari spesies Neisseria flava juga berkontribusi pada gigi berlubang, dengan kehadiran yang lebih besar di lidah. Mayoritas bakteri di lidah termasuk dalam spesies taksonomi Actinomyces sp. Mereka adalah penjajah besar mukosa manusia, karena kita tidak hanya menemukannya di mulut, tetapi juga di seluruh sistem pencernaan dan saluran kemih. Bakteri ini biasanya menyertai semua selaput lendir Veillonella dispar dan Rothia sp, itu adalah actinobateria lain yang sangat umum. Dua yang pertama mampu mendegradasi nitrat menjadi nitrit, meningkatkan penyerapan senyawa ini oleh tubuh.
Sedangkan Actinomyces dan Veillonella terletak di ujung dan daerah tengah lidah. Baik N. flava maupun Rothia sp, tersusun pada lidah membentuk garis-garis melintang pada otot di sisi-sisinya. Susunan ini telah diverifikasi dalam sampel yang berbeda, sehingga telah disimpulkan bahwa ada variasi anatomi lidah atau dalam kondisi yang menguntungkan untuk beberapa bakteri ini dan tidak untuk yang lain.