Memahami pentingnya fragmen Okazaki membutuhkan pengetahuan dasar tentang replikasi DNA. Ketika sebuah sel menerima sinyal internal atau eksternal bahwa ia harus berkembang biak, salah satu hal pertama yang harus dilakukan adalah menyalin materi genetiknya, fenomena ini dikenal sebagai proses replikasi DNA. Pada prokariota lebih sederhana, karena karakteristik genom prokariotik.
Sebuah gambar sangat penting untuk memahami pembentukan fragmen Okazaki. Dengan demikian, indra dan utas yang disalin jauh lebih baik dipahami.
Dalam eukariota itu adalah proses yang kompleks di mana serangkaian enzim yang sangat spesifik campur tangan. Pada proses eukariotik ini, enzim helikase memutuskan ikatan hidrogen dari untaian DNA yang terbuka seperti ritsleting dalam satu arah. Arah ini bertepatan dengan indra 5 ‘-> 3’ dari salah satu dari dua untai DNA dan indra 3 ‘-> 5’ dari yang lain. Sebuah RNA Primase mensintesis primer yang diperlukan untuk tahap pemanjangan replikasi berlangsung. Replikasi itu sendiri dilakukan oleh keluarga enzim DNA polimerase , yang menyalin salah satu dari dua untai DNA.
The DNA polimerase III , DNA pol III disingkat, khusus dalam pemanjangan rantai polimerase baru memiliki 5 ‘-> 3’. Artinya, DNA pol III menggabungkan basa nitrogen (adenin, guanin, sitosin atau timin) dalam arti 5 ‘-> 3’ dari rantai DNA baru, karena membutuhkan gugus -OH, yang terletak di posisi 3 ‘untuk dapat untuk menghubungkan ujung 5’ alas baru untuk dimasukkan ke dalam untaian baru. Inilah sebabnya mengapa Anda memerlukan primer RNA dengan ujung 3 ‘untuk mulai menambahkan basa baru. Untai yang bertindak sebagai templat untuk untai baru disebut untai templat atau untai negatif atau pemimpin. Saat itulah ketika masalah muncul, ketika sebuah untai DNA dicabut dan dibuka, kami memiliki untaian yang menuju ke arah 5 ‘-> 3’ dan yang lain ke arah 3 ‘-> 5’. Seperti yang telah kami katakan, DNA pol III hanya dapat menggabungkan basa baru dalam arah 5 ‘-> 3’, jadi apa yang terjadi pada untai yang tetap terbuka di arah 3 ‘-> 5’?
String dalam arah 3 ‘-> 5’ ini memiliki banyak kekurangan. Untuk memulai DNA untai tunggal sangat berbahaya dan mungkin keliru dikenali sebagai DNA asing dan mencoba untuk mendegradasi, jadi ketika helikase memisahkan dua rantai bergabung dengan untai tunggal sejumlah besar beberapa protein kecil yang disebut protein SSB (dari Protein pengikat untai tunggal bahasa Inggris) yang mencegah aksi enzim degradatif dan mencegah basa untai tunggal DNA bergabung dengan basa untai yang sama. Selain itu, untuk mencegah untai DNA terpuntir, enzim topoisomerase juga bertindak dengan mendukung penyatuan ini .
Untai ini, yang juga terbuka tetapi di mana DNA pol III tidak bekerja, menggabungkan primer RNA sebagai untai 5 ‘-> 3’. Perpanjangan rantai ini lebih rumit karena dibuat menjadi potongan-potongan yang lebih kecil dari rantai pelengkapnya. The DNA polimerase? (delta) bertugas menambahkan basa nitrogen baru ke primer rantai indra ini. Ini memang fragmen DNA kecil yang terbentuk di 5 ‘-> 3’ arah pada untai yang salinan 5 ‘-> 3’ untai, yang disebut fragmen Okazaki.