Saat ini ada minat khusus dalam hubungan antara keanekaragaman hayati, yang didefinisikan secara sederhana sebagai jumlah spesies yang ada dalam sistem dan fungsinya di dalam tanah. Ini adalah bagian dari perhatian yang lebih umum untuk melestarikan keanekaragaman hayati dan perannya dalam menjaga fungsi biosfer. Asumsi yang tidak diungkapkan dalam banyak penelitian saat ini adalah bahwa (i) dengan mengkarakterisasi keanekaragaman, seseorang akan dapat memahami dan memanipulasi fungsi ekosistem dan (ii) kemampuan ekosistem untuk menahan gangguan parah mungkin sebagian bergantung pada keanekaragaman hayati. sistem.
Di sisi lain, ada semakin banyak bukti eksperimental yang menunjukkan bahwa sebagian besar organisme secara fungsional berlebihan dan bahwa karakteristik fungsional spesies komponen setidaknya sama pentingnya dengan jumlah spesies dalam mempertahankan proses esensial. Kami percaya bahwa setidaknya jumlah minimum spesies sangat penting untuk berfungsinya ekosistem dalam kondisi stabil dan bahwa sejumlah besar spesies mungkin penting untuk mempertahankan proses yang stabil dalam menghadapi perubahan lingkungan, yang disebut ‘hipotesis asuransi’.. Namun, teori kami tentang ekosistem terestrial telah dikembangkan dari pengamatan di lapangan, sementara secara komparatif beberapa studi telah dilakukan di lapangan. Oleh karena itu, hubungan antara keanekaragaman hayati dan fungsi tanah kurang dipahami.
Tanah sangat penting dan tak tergantikan; ia mengatur produktivitas tanaman di ekosistem terestrial dan mempertahankan siklus biogeokimia karena mikroorganisme di tanah mendegradasi, cepat atau lambat, hampir semua senyawa organik. Populasi hidup yang menghuni tanah meliputi makrofauna, mesofauna, mikrofauna, dan mikroflora.
Tanah merupakan sistem biologis yang kompleks dan dinamis, dan masih sulit untuk menentukan komposisi komunitas mikroba di dalam tanah. Kami juga terbatas dalam menentukan reaksi yang dimediasi mikroba karena pengujian saat ini untuk menentukan tingkat keseluruhan proses metabolisme lengkap (seperti respirasi) atau aktivitas enzim tertentu (seperti aktivitas urease, protease, dan fosfomonoesterase) tidak memungkinkan untuk identifikasi apa pun. komposisi mikroba, spesies yang terlibat langsung dalam proses yang diukur. Masalah utama yang ditimbulkan oleh hubungan antara keanekaragaman mikroba dan fungsi tanah adalah untuk memahami hubungan antara keanekaragaman genetik dan struktur komunitas dan antara struktur dan fungsi komunitas. Pemahaman yang lebih baik tentang hubungan antara keanekaragaman mikroba dan fungsi tanah tidak hanya membutuhkan penggunaan pengujian yang lebih tepat untuk karakterisasi taksonomi dan fungsional DNA dan RNA yang diekstraksi dari tanah, tetapi juga teknik resolusi tinggi untuk mendeteksi sel. mikroba aktif dalam matriks tanah.
Pendekatan holistik, berdasarkan membagi sistem ke dalam kelompok-kelompok dan mengukur arus yang menghubungkan kelompok-kelompok ini, adalah yang paling efisien. Penentuan kandungan C, N, P dan S dalam mikroba melalui teknik fumigasi memungkinkan untuk mengukur dinamika unsur hara dalam tanah. Namun, kemajuan lebih lanjut memerlukan penentuan kelompok baru, seperti biomassa mikroba aktif, juga dengan teknik molekuler.