Ketika kita berbicara atau membaca tentang taksonomi dan evolusi, kita sering menemukan kata monofiletik, polifiletik, atau parafiletik. Kata sifat ini tidak boleh membuat kita kedinginan atau melewatkannya dan melanjutkan membaca seolah-olah tidak ada yang lain karena mereka dapat memberi kita banyak informasi tentang kelompok makhluk hidup yang sedang kita pelajari.
Takson monofiletik adalah takson yang memiliki nenek moyang yang sama. Pada akhirnya, semua makhluk hidup memiliki nenek moyang yang sama, sehingga dapat dikatakan bahwa mereka semua monofiletik. Tapi itu mengacu pada nenek moyang yang sama dan baru-baru ini dalam istilah evolusi. Misalnya, semua karnivora memiliki nenek moyang yang sama, menjadikannya kelompok monofiletik.
Grup polifiletik (perhatikan bahwa kami telah mengatakan grup dan bukan takson) adalah grup yang berisi beberapa grup makhluk hidup tetapi tidak semua nenek moyang sampai mencapai nenek moyang yang sama. Contoh paling jelas adalah burung dan mamalia, sering kali dikelompokkan sebagai hewan berdarah panas, hewan darat, dll. Namun, karena nenek moyangnya termasuk dalam kelompok reptil, kelompok hewan berdarah panas adalah polifiletik. Dalam taksonomi bakteri atau prokariotik adalah normal untuk menggunakan perlakuan ini karena terkadang hubungan dua kelompok taksonomi yang menunjukkan ciri-ciri umum belum diketahui.
Akhirnya, kelompok parafiletik adalah kelompok di mana tidak semua keturunan disertakan. Melanjutkan analogi sebelumnya, reptil adalah kelompok paraphyletic, karena ketika kita mengacu pada mereka, kita tidak termasuk mamalia dan burung meskipun mereka adalah taksa yang secara evolusi diturunkan dari reptil.
The protista adalah kelompok polifilético dan parafilético sejak mencakup semua organisme uniseluler dan multiseluler tanpa hubungan yang mapan dengan salah satu kerajaan taksonomi konvensional.
Untuk memahami mengapa konsep-konsep ini digunakan, Anda harus kembali ke sebelum mereka ada.
Perangkat genetik saat ini dan tidak seperti saat ini memungkinkan tingkat kepercayaan hubungan yang tinggi menjelaskan hubungan antara dua kelompok makhluk hidup dengan membandingkan urutan DNA atau peptida . Berkat metode ini dan sifat mutabilitas materi genetik, kami tidak hanya dapat membangun hubungan dekat antara dua spesies, tetapi kami bahkan dapat menentukan kapan (kurang lebih) mereka terpisah secara evolusi. Sebelum mengembangkan teknik ini dan dari teori evolusi Darwin, karakter eksternal digunakan untuk membandingkan dua spesies atau kelompok yang lebih tinggi dan membangun hubungan evolusioner. Pada prinsipnya, perbedaan antara kelompok taksonomi (spesies, genera, famili, kelas, ordo, dll.) mudah ditentukan, setidaknya untuk sebagian besar dari mereka.
Namun, dari waktu ke waktu biologi taksonomi menemukan spesies yang menggabungkan karakteristik dua genera misalnya. Ada kemungkinan bahwa spesies ini muncul pada saat diversifikasi kedua kelompok, tetapi yang mana dari keduanya? Nah, sebelum alat genetik, perlu untuk memilih memberi bobot lebih pada satu atau karakteristik fisik, etologis atau lainnya di atas yang lain untuk memasukkannya ke dalam satu kelompok atau lainnya. Jelas, ini menghasilkan banyak diskusi tentang karakter mana yang dianggap paling penting (saat ini diskusi ini terus berlanjut tentang karakter genetik mana yang harus diperhitungkan). Singkatnya, dengan munculnya alat genetik, ditemukan bahwa banyak spesies (dan kelompok yang lebih tinggi) tidak diklasifikasikan dengan benar. Namun, klasifikasi itu fungsional .