Di antara teknik yang dapat digunakan untuk mengamati lokasi protein tertentu dalam konteks jaringannya, kami menemukan imunohistokimia. Teknik ini didasarkan pada pengenalan antibodi oleh protein spesifik dan reaksi kimia enzimatik yang mengungkapkan posisinya.
Pertama, Anda harus mendapatkan antibodi yang secara khusus mengenali protein yang diinginkan. Untuk ini, hal yang paling normal adalah memperkuat protein yang diinginkan pada bakteri atau ragi terlepas dari asalnya (hewan atau nabati) dalam jumlah besar dan dari sana memurnikannya. Memperoleh ekstrak protein yang diinginkan bukanlah proses yang mudah karena ketika mencoba menghasilkannya dalam jumlah besar dapat menjadi tidak larut, membentuk agregat atau masuk ke badan inklusi dengan pelipatan yang salah. Ketika pemurnian yang benar akhirnya tercapai, itu disuntikkan ke hewan, biasanya tikus, kambing, tikus atau kelinci. Berkat sistem kekebalan hewan, antibodi spesifik akan dihasilkan melawan protein yang telah kita suntikkan ke dalamnya dan yang dikenali tubuh sebagai benda asing. Selama bulan-bulan berikutnya, darah hewan akan diambil untuk memurnikan antibodi spesifik, yang akan kita sebut primer.
Kembali ke laboratorium, antibodi itu akan diterapkan pada sampel jaringan yang ingin kita amati apakah ada proteinnya. Mengikuti protokol, antibodi sekunder harus diterapkan selanjutnya, yang akan berbeda tergantung pada hewan yang digunakan untuk menghasilkan antibodi primer. Antibodi kedua ini telah dihasilkan terkait dengan enzim yang mampu mengungkapkan posisinya, baik dengan fluoresensi atau dengan chemiluminescence, seperti luminol yang bereaksi dengan hidrogen peroksida dan dalam keadaan ini memancarkan cahaya. Dalam protokol ini, antibodi sekunder terikat pada peroksidase, enzim yang mampu memecah hidrogen peroksida (hidrogen peroksida). Ketika ini ditambahkan bersama dengan luminol, antibodi sekunder memotong molekul kaya oksigen dan luminol dapat menggunakannya sebagai substrat untuk memancarkan cahaya. Dengan cara ini, lokasi di jaringan tempat antibodi sekunder ditemukan terungkap, yang secara spesifik akan menjadi tempat antibodi primer ditemukan dan pada gilirannya akan menjadi tempat protein yang diinginkan diekspresikan.
Dengan teknik imunohistokimia ini, lokalisasi protein dalam jaringan dapat dideteksi. Bahkan mungkin untuk membedakan jenis sel mana yang menghasilkan protein tertentu atau di mana protein itu terletak di dalam sel, di membran, di sitoplasma, di nukleus atau di organel lain, dll. Selanjutnya, dengan teknik ini, karena memungkinkan dilakukannya pengamatan lokasi protein di seluruh jaringan, dapat dilihat apakah protein diekspresikan dengan cara tertentu atau dengan membentuk gradien di jaringan atau sebagai respons terhadap sinyal lain.
Namun teknik ini tidak hanya digunakan di laboratorium, dalam kedokteran teknik ini sering digunakan untuk mengidentifikasi adanya protein terkait penyakit dalam sampel darah atau jaringan lain. Hal ini umum dalam diagnosis kanker, di mana antibodi yang berbeda dapat diterapkan pada protein yang berbeda dan dengan demikian membedakan antara berbagai jenis kanker.