Intron adalah urutan DNA yang ditranskripsi menjadi RNA, tetapi tidak akan menimbulkan rantai asam amino protein. Urutan ini dihapus selama fase RNA. Berikut adalah sedikit pengenalan . Fungsi mereka tidak sepenuhnya jelas, meskipun hipotesis yang paling diterima adalah bahwa mereka adalah bagian mendasar dari generasi protein karena mereka memungkinkan pengocokan ekson dan oleh karena itu meningkatkan jumlah protein berbeda yang dapat disintesis dengan satu urutan DNA. Tetapi juga telah ditunjukkan bahwa mereka campur tangan dalam proses regulasi ekspresi gen dalam berbagai situasi seperti kekurangan atau bahwa kehadiran mereka mempertahankan kerusakan pada urutan DNA . Asal usulnya masih belum jelas dan ada dua teori dalam hal ini: teori intron awal dan teori intron akhir .
Meskipun ada intron di beberapa prokariota, secara umum mereka khas eukariota dan menyajikan hubungan tertentu antara jumlah intron -dan urutan non-coding lainnya- dan kompleksitas organisme. Tergantung pada kompleksitas yang dibutuhkan untuk menghapus intron, ada 4 jenis. Kami telah membahas tipe I , II, dan III dalam artikel Anda sendiri . Tipe I dan II dicirikan sebagai autocatalytic , yaitu, mereka tidak memerlukan apa pun selain urutannya sendiri untuk dihilangkan – atau penyambungan – sedangkan yang disebut tipe III dan tipe IV, membutuhkan mesin tertentu , yang disebut spliceosome pada tipe III. Kadang-kadang intron tipe III dan tipe IV dikelompokkan bersama sebagai intron nuklir.
Intron tipe IV adalah yang paling tidak otonom , karena mereka membutuhkan enzim untuk dihilangkan. Mereka ditemukan secara eksklusif di inti eukariota, tetapi tidak di organelnya, dan di archaea. Semua intron jenis ini terdapat pada sekuens tRNA -transfer RNA-, sekuens RNA yang mengadopsi struktur tiga dimensi dengan derajat tumpang tindih sekuens yang tinggi. Di dalamnya, kehadiran sekuens ini dapat mencegah tumpang tindihnya untaian RNA sebelum membentuk tRNA. Selain tipe IV, intron tipe I telah ditemukan di tRNA. Dalam kasus tipe III, spliceosome atau spliceosome terdiri dari RNA kecil dan polipeptida, tetapi dalam kasus tipe IV, partisipasi enzim sendiri diperlukan untuk bertindak pada tRNA, seperti endonuklease untuk memotong untai tRNA. dan tRNA ligase untuk bergabung kembali dengan ujung ekson. Kedua jenis protein tersebut dapat bertindak secara independen dan membutuhkan energi untuk bertindak dalam bentuk ATP, yang akan dioksidasi menjadi AMP dalam kasus ligase.
The endonuklease terdiri dari 4 subunit, 2 katalitik dan 2 struktural. Pemotongan untai akan berlangsung dalam satu langkah di mana urutan intronik yang memiliki sekitar 80 basa nitrogen dipotong.
The ligase memiliki pusat katalitik dan mengikat Magnesium AMP. Dalam proses dua langkah, pertama-tama Anda akan melampirkan salah satu ujung tRNA yang akan dilewati grup AMP. Setelah dimuat, ini akan memungkinkan kedua ujungnya bergabung dengan aksi katalitik ligase, melepaskan AMP dan untai yang dilarutkan.