Seperti yang telah kita bahas dalam artikel lain, klasifikasi makhluk hidup adalah salah satu tahap pertama yang diperlukan dalam mempelajari kehidupan. Klasik Yunani yang dipimpin oleh karya-karya Aristoteles sudah memahami bahwa makhluk hidup pada waktu itu dapat diklasifikasikan menjadi hewan dan tumbuhan. Organisasi hewan dan tumbuhan menyebabkan pengetahuan tentang mereka yang memungkinkan untuk berkembang, dengan perbandingan antara kelompok yang berbeda, bidang lain dari pengetahuan biologi lebih cepat, seperti fisiologi hewan atau penyerbukan tanaman berbunga. Selanjutnya, gagasan untuk mengklasifikasikan makhluk hidup menurut kesamaan tertentu merupakan langkah yang sangat diperlukan dalam pengembangan teori evolusi Darwin.
Abad ke-18 adalah waktu yang sangat menarik dalam hal ini. Pertama-tama, Carlos von Linné (Linnaeus) menyelesaikan ” Sistema Naturae “, salah satu karya kunci taksonomi, yang sangat berguna saat ini dan yang telah menyebutkan sebagian besar hewan, tumbuhan, dan jamur yang dikenal , memberi mereka pemahaman ilmiah nama yang dalam banyak kasus itu akan berlaku sampai hari ini. Pada saat yang sama Lamarck dan naturis terkenal lainnya pada saat itu menyajikan karya serupa tentang organisasi makhluk hidup.
Bahkan, dalam karya Lamarck (di beberapa tempat disebut sebagai Lemarck) dia sudah mengajukan teori evolusi, di bawah moto ” keharusan menciptakan organ “. Sementara teorinya revolusioner dan akan membuka pintu ke bidang pengetahuan yang sama sekali baru, sejarah tidak memperlakukannya dengan rasa hormat yang layak diterimanya. Munculnya teori yang diajukan oleh Darwin di atas panggung, menutupi kontribusi besar Lamarck, seorang pelopor dalam evolusi. Berkat karya Lamark dan Darwin , tahap baru dimulai, di mana taksa harus mengumpulkan hubungan kekerabatan dan didasarkan pada evolusi.
Sebelumnya, pada pertengahan abad ketujuh belas, konsep sel mulai dibahas oleh Hooke naturis dan pandangan mikroskopis pertamanya. Pada saat teori evolusi pertama tiba, pada abad ke-18, konsepnya tidak jelas dan masih butuh satu abad lagi bagi ahli alam James Hogg pada tahun 1860 untuk menerbitkan karyanya tentang organisme mikroskopis yang telah ia gambarkan dan klasifikasikan. Untuk yang terakhir, dia melihat perlunya menciptakan Kerajaan baru, karena apa yang dia lihat tidak bisa berupa hewan atau tumbuhan. Jadi istilah Protoctista diciptakan, yang menyatukan organisme mikroskopis yang membela bahwa menjadi lebih sederhana mereka harus berevolusi sebelum yang lebih kompleks lainnya. Tak lama setelah itu, Ernst Haeckel pada tahun 1874 mendefinisikan Protista sebagai kerajaan ketiga makhluk hidup, homolog dengan Protista uniseluler Hogg dan yang tetap berlaku hingga hari ini. Pada titik ini banyak jamur yang saat ini kami klasifikasikan dalam kerajaan Fungui mereka sendiri masih termasuk dalam kelompok baru dan tidak jelas ini yang sedang berlangsung untuk mengenali perbedaan antara bakteri, archaea, jamur, dll.
Baru pada abad berikutnya Ernst Heinrich, berkat kemajuan mikroskop, mengamati perbedaan seluler yang paling penting, keberadaan inti dan organel. Hal ini akan menimbulkan perubahan baru dalam sistematika alam. Tapi itu sudah sejarah kontemporer.