Mereka menemukan virus bakteri baru di usus manusia

Virus baru yang ditemukan setiap tahun adalah hal yang wajar. Berkat teknik baru dan semakin kuat dan menentukan yang digunakan di bidang genomik , bukti DNA dari organisme dapat ditemukan dalam sampel dengan akurasi yang meningkat dan dengan konsentrasi yang lebih rendah.

Virus ini hidup di usus manusia.

Inilah tepatnya yang terjadi di Universitas San Diego (AS), di mana sekelompok ahli bioinformatika menganalisis DNA sampel tinja untuk menemukan urutan DNA virus untuk penelitian yang dipimpin oleh Bas E. Dutilh . Relevansi terbesar dari penemuan ini adalah bahwa studi pendahuluan tampaknya menunjukkan bahwa virus ini akan berada di lima puluh persen populasi manusia. Jadi akan ” bersembunyi ” dari pencarian virus baru. Dalam karya yang diterbitkan mereka memperingatkan bahwa bakteriofag ini hingga 6 kali lebih banyak daripada fag lain yang dikenal .

Tim biologi komputasi di Universitas San Diego menemukan bahwa mereka memiliki urutan DNA yang sangat panjang (97 Kb, 97.000 pasangan basa) di setengah dari sampel yang mereka kerjakan. Setelah temuan ini, mereka melihat database Proyek Mikrobioma Manusia dari National Institute of Health NIH , di mana urutan semua mikroorganisme yang telah diurutkan dari sampel tinja manusia diberi keterangan dan ditemukan bahwa itu muncul dalam sejumlah besar sampel, meskipun tidak diklasifikasikan sebagai virus baru.

Fakta bahwa virus ini luput dari perhatian dijelaskan dengan memahami metode analisis urutan DNA dari jenis penelitian ini. Studi genomik menghasilkan sejumlah besar data ( jutaan urutan ). Dari data tersebut, sebagian kecil seringkali diperlukan untuk studi tertentu. Sisa data dipublikasikan untuk penggunaan umum Anda, tidak diselidiki oleh penemunya sendiri.

Virus baru tersebut diberi nama crAssphage , untuk menghormati program pemrosesan urutan DNA yang menemukan keberadaannya. Virus ini menginfeksi sekelompok bakteri, Bacteroidetes, yang merupakan patogen umum di usus manusia. Filum bakteri ini tampaknya terkait dengan beberapa penyakit seperti beberapa jenis diabetes atau obesitas dan penyakit usus lainnya. Namun, hubungan antara virus baru ini dan interaksi bakteri dan usus masih belum dipahami dengan baik.

Sampel bayi baru lahir tidak menunjukkan virus ini , jadi semuanya tampaknya menunjukkan bahwa virus itu didapat selama tahun-tahun pertama kehidupan. Fakta bahwa virus ini ditemukan pada sebagian besar spesies manusia dapat menjadi indikasi usia evolusi virus, menempatkannya di antara virus tertua, hampir sejak kemunculannya sebagai manusia.

Penemuan ini dipublikasikan di Nature Communications No. , dengan nama:

… Dan dapat diunduh dari internet (dalam bahasa Inggris) dari sini .

Related Posts