ORF8 urutan yang tidak diketahui dari coronavirus yang membawa rahasia

Hanya dalam beberapa bulan dari pandemi COVID-19, kita telah belajar banyak tentang virus yang sama sekali tidak dikenal umat manusia sebelumnya. Kami merujuk pada SARS-CoV-2 , virus yang menyebabkan pandemi. Meskipun benar bahwa studi genomik menghubungkannya dengan coronavirus kelelawar lain atau yang menyebabkan SARS , kenyataannya ia memiliki karakteristik unik. Penyebab molekuler di balik kesuksesan besar virus dalam menginfeksi manusia masih belum pasti. Salah satunya, yang tampaknya menjadi kunci dalam perkembangan penyakit, ditemukan di ORF8. Kerangka baca terbuka dalam bahasa Inggris adalah urutan materi genetik, dalam hal ini RNA, yang berpotensi diterjemahkan menjadi asam amino. Mereka dicirikan dengan memiliki metionin, asam amino pertama selalu dela transkripsi. Selanjutnya, urutan lain yang berdekatan yang merekrut polimerase harus ditemukan untuk menentukan efisiensi ORF untuk ditranskripsi.

ORF8 memungkinkan transkripsi peptida asam amino 121 dan sangat berbeda antara SARS-CoV2 dan SARS, meskipun hanya sebagian kecil dari urutannya yang telah diurutkan (sekitar 20%) ini telah terbukti berbeda secara signifikan antara kedua spesies. Kerangka baca ini tampaknya menghasilkan rantai peptida aksesori dengan kemampuan untuk berinteraksi dengan hasil ORF7 dengan cara yang tidak diamati pada SARS-CoV. ORF8 tidak mengkode protein esensial virus, tetapi penghapusan 29 nukleotida di SARS-CoV1 menghasilkan strain yang lebih ringan, serta penghapusan di ORF8 dari SARS-CoV2 selama tahap awal pandemi 382 nukleotida telah hasil yang serupa.

Sebagai protein, lipatan yang mirip dengan imunoglobulin telah diprediksi dan akan memiliki wilayah interaksi dengan retikulum endoplasma, di antara kemungkinan interaksi lainnya. Antibodi anti-ORF8 telah ditemukan pada pasien yang telah melewati COVId-19, itulah sebabnya diyakini bahwa protein ini akan berjalan dari UGD ke luar sel. Padahal, keberadaan antibodi tersebut merupakan salah satu penanda yang paling banyak digunakan untuk tes antigen COVID-19. Tidak ada studi tentang struktur tiga dimensi dari setiap ORF8 dari coronavirus lain, dan orang-orang dari SARS-CoV2 mulai membuahkan hasil, prediksi tampaknya menunjukkan kemungkinan pembentukan dimer, tetapi tidak ada protein yang mirip dengannya yang diketahui. Fakta bahwa tidak ada protein yang serupa memiliki sisi baiknya, sejak itu mereka lebih mungkin dideteksi sebagai penyusup oleh sistem kekebalan dan sisi buruknya, karena tidak ada petunjuk yang dapat diandalkan tentang apa fungsinya. Hal terdekat yang kami temukan sebenarnya adalah virus itu sendiri, karena ini adalah ORF7-nya, meskipun ini jauh lebih kecil dari 8 dan kesamaannya sangat kabur.

Di laboratorium dimungkinkan untuk mereplikasi protein yang dikodekan dalam ORF8 pada bakteri secara artifisial, penelitian sekarang sedang dilakukan untuk menentukan mana dari semua kemungkinan interaksi yang telah dijelaskan dalam silico yang ditemukan in vivo .

Related Posts