The RNA adalah jenis asam ribonukleat , mirip dengan DNA. Karakteristiknya telah membuat sebagian besar organisme membuangnya sebagai bahan penyimpan informasi genetik. Namun, sistem translasi dari DNA ke protein selalu melalui tahap RNA. DNA disalin menjadi RNA dalam proses yang disebut transkripsi. Kemudian RNA akan diterjemahkan, pada ribosom, menjadi protein .
Struktur sekunder tRNA memungkinkan pengenalan asam amino, ribosom, dan interaksi lainnya.
Pada langkah translasi inilah 3 jenis RNA yang berbeda terlibat. Messenger RNA (mRNA), yang merupakan salinan DNA. RNA ribosom (rRNA), yang merupakan bagian dari mesin ribosom. Dan RNA transfer (tRNA), yang bertanggung jawab untuk membawa asam amino yang melengkapi mRNA ke ribosom untuk membentuk protein. Pada artikel lain kami membahas tentang struktur dan fungsi tRNA, Anda dapat membacanya di sini .
Pada artikel ini kita akan fokus pada bagaimana mereka terbentuk, siapa yang mensintesisnya dan dalam jumlah berapa.
Transkripsi : Baik 5S rRNA dan tRNA disintesis oleh RNA polimerase unik, RNA polimerase III . Polimerase ini juga mensintesis RNA kecil (snRNA), yang fungsinya sangat sedikit diketahui. Polimerase II bertanggung jawab untuk menghasilkan mRNA dan polimerase I mentranskripsi sisa RNA ribosom. Untuk mentranskripsi tRNA, polimerase III mengenali sekuens yang disebut kotak A dan B di dalam sekuens DNA , daripada di wilayah atau promotor sebelumnya seperti pada gen. Untuk transkripsinya, dua faktor transkripsi diperlukan, yang disebut TFIII B dan C. TFIIIC mengenali kotak A dan B dari urutan DNA dan TFIIIB menempatkan polimerase II pada kotak tersebut untuk inisiasi transkripsi . Akhir transkripsi tRNA terjadi dengan tiga sinyal timin dalam urutan DNA.
Modifikasi tRNA pasca-transkripsi: Setelah sintesisnya, tRNA diproses sebelum berfungsi.
Di antara modifikasi kami menemukan penghapusan beberapa nukleotida di kedua ujung rantai RNA. Di ujung 5 ‘, ribonuklease P mengintervensi dan di ujung 3’ oleh RNase D, yang juga menggabungkan urutan CCA (yang akan menjadi urutan asam nukleat yang akan bergabung dengan asam amino yang akan mengangkut tRNA).
Selain itu, tRNA juga kehilangan intron di daerah antikodon , daerah yang akan mengenali mRNA. Sebagian besar intron tRNA adalah tipe II, yaitu autokatalitik. Tidak ada snRNA dalam bentuk apa pun yang diperlukan untuk menghilangkannya. Beberapa intron dari tRNA adalah tipe IV. Mereka dieliminasi oleh aksi enzim endonuklease dan tRNA diturunkan oleh enzim ligase, juga jika intervensi snRNA. Jenis intron ini sangat jarang ditemukan pada jenis RNA lainnya. Kedua jenis intron secara evolusioner lebih awal, menunjukkan asal mula pembentukannya . Anda dapat membaca lebih lanjut tentang asal usul tRNA dan situasinya dalam genom dalam artikel yang kami dedikasikan di sini .
Akhirnya tRNA dimodifikasi secara epigenetik, dengan metilasi, reduksi dan isomerisasi dari beberapa basa nitrogennya, yang akan menyebabkan tRNA menghadirkan basa yang jarang seperti timin atau asam inosilat.