Darah adalah jaringan hewan yang harus beredar di dalam pembuluh darah. Namun, terkadang terjadi situasi di mana pembuluh darah pecah dan darah mulai mengalir, baik keluar dari tubuh atau keluar dari pembuluh. Bagaimanapun kebocoran cairan harus dihentikan, dan sesegera mungkin. Rata-rata orang menjadi tidak sadar setelah kehilangan 10% darah (lebih dari setengah liter) dan jika dia kehilangan 40%, sekitar 2 liter, dia mati.
Untungnya, tubuh siap untuk insiden yang sangat sering terjadi ini. Salah satu enzim yang paling penting dalam proses penyembuhan luka adalah trombin. Prekursor trombin yang tidak aktif, yang disebut protrombin atau faktor koagulasi II, terbentuk di hati (tempat pembentukan sebagian besar faktor yang diperlukan untuk menutup luka). Protrombin ditemukan dalam plasma darah dan hanya akan diaktifkan terhadap cedera pembuluh darah.
Ketika pembuluh darah pecah, trombosit dalam darah pecah. Trombosit memiliki sejumlah besar faktor pembekuan di membrannya yang dilepaskan ke dalam luka. Di antara mereka kita menemukan faktor V, VIII, IX, atau X, dan mereka juga melepaskan tromboplastin (terbentuk dari faktor jaringan atau faktor koagulasi III. Tromboplastin diaktifkan oleh adanya ion Ca2 + (dilepaskan dari bagian dalam trombosit saat pecah), yang bertindak sebagai kofaktor dan dalam hal ini dapat disebut sebagai faktor koagulasi IV. Fungsi tromboplastin adalah mengubah protrombin menjadi trombin aktif. Dengan semakin besar kerusakan pembuluh darah, semakin banyak tromboplastin yang terbentuk dan konversi protrombin trombin berbanding lurus dengan jumlah tromboplastin, atau sama dengan jumlah kerusakan pembuluh darah.
Tromboplastin memotong protrombin di beberapa tempat, mengubah rantai polipeptida menjadi 3 fragmen. Salah satu fragmen ini dibelah untuk mengaktifkan sisanya, tetapi selain itu, polipeptida yang akan aktif dipotong sekali lagi. Sedemikian rupa sehingga trombin terdiri dari dua peptida yang terpisah.
Protrombin dikodekan pada lengan pendek kromosom 11 pada manusia, di wilayah 11 (11p11) dan gen tersebut disebut F2, oleh faktor koagulasi II. Pada tingkat biokimia, trombin adalah glikoprotein, kurang lebih melingkar, dan dengan aktivitas proteolitik. Trombin memiliki bagian gula dan protein yang terdiri dari dua rantai polipeptida, masing-masing terdiri dari 36 dan 259 asam amino, yang disatukan oleh jembatan disulfida dan memiliki berat molekul 33,7 KDa. Metode kerja trombin untuk menutup luka adalah dengan mengubah fibrinogen (juga disebut faktor pembekuan I) menjadi fibrin. Ketika ini terjadi, fibrin mulai berinteraksi satu sama lain, secara harfiah membentuk jaringan tiga dimensi yang berinteraksi dengan tepi luka dan dengan fibrin lain untuk menyumbat luka di pembuluh darah. Obat antikoagulan yang paling umum memiliki metode aksi untuk mencegah aktivitas trombin dalam konversi fibrinogen menjadi fibrin.