Kalsium karbonat merupakan salah satu komponen yang paling melimpah di kerak bumi. Di perairan permukaan kontinental dan samudera ditemukan dalam konsentrasi yang sangat tinggi, hampir jenuh. Mungkin kelimpahannya yang menyebabkan makhluk hidup menggunakannya untuk membentuk struktur mereka yang paling tahan. Pada hewan, kerangka dibentuk oleh endapan mineral ini dalam struktur organik. Sepanjang sejarah kehidupan, akumulasi kerangka dengan kalsium karbonat dalam bentuk sedimen telah menghasilkan jenis batu yang sangat umum, yang disebut batu kapur. Batuan kapur ini terbentuk ketika dunia terendam air dan semua kehidupan adalah laut. Saat ini pembentukan batugamping karena pengendapan cangkang dan kerangka berkapur jauh lebih sedikit. Salah satu contoh terbaik makhluk hidup yang mengambil kalsium karbonat dalam jumlah besar dari air adalah terumbu karang.
Secara kimiawi kalsium karbonat adalah gabungan antara atom kalsium (Ca2+) dan radikal karbonat (CO3)2-. Ini membentuk kristal putih dan kekerasannya rendah. Dalam larutan, inilah yang memberi air karakteristik air “keras”.
Kelompok makhluk hidup yang sangat beragam menggunakan endapan kalsium karbonat untuk mengeraskan strukturnya, dari alga hingga vertebrata. Spons hewan pertama sudah memasukkannya ke dalam kerangka mereka dalam bentuk spikula (sebenarnya kelompok spons di mana ia hadir membentuk kelas taksonomi Calcarea ). Kerangka mereka, dengan bentuk yang sangat beragam dan mengesankan, dibentuk oleh pengendapan kalsium karbonat dalam bentuk aragonit atau kalsit. Karang dapat membentuk struktur kaku berdasarkan kalsium atau lunak jika mereka menggabungkannya dalam bentuk spikula di jaringan berdaging mereka. Meskipun perlu dicatat bahwa ada karang yang mampu menghasilkan struktur keras tanpa deposit kalsium.
Dengan cara yang sama, ada ganggang dengan endapan berkapur, namun, dalam hal ini mereka tidak membentuk kelompok taksonomi tunggal, tetapi karakteristik ini tersebar luas di antara beberapa kelompok. Alga ini menggunakan endapan aragonit atau kalsit untuk menjaga batangnya tetap tegak, karena alga ini umumnya bentik. Cyanobacteria juga diketahui menggunakan endapan kalsium karbonat untuk mengeraskan strukturnya.
Pada vertebrata, penggunaannya sebagai bahan tahan tersebar luas, di cangkang telur, misalnya, yang dengan cara ini mengalami dehidrasi lebih sedikit daripada pendahulu evolusi mereka, amfibi. Dalam tulang dan gigi, kalsium terakumulasi dalam bentuk hidroksiapatit, senyawa yang terdiri dari kalsium fosfat, yang disintesis dari CaCO3 yang dikonsumsi dalam makanan.
Dalam pakan ternak, diet sering dilengkapi dengan kalsium karbonat dalam bubuk atau semolina asal biologis untuk meningkatkan konstitusi hewan dan juga menambahkan beberapa unsur yang ada dalam tinja kerangka, seperti molibdenum, magnesium atau mangan. Di bidang pertanian juga dapat digunakan untuk memodifikasi pH tanah, jika terlalu asam, sehingga membantu ketersediaan hara tanah yang lebih besar bagi tanaman, terutama fosfor.