Retrovirus manusia yang bukan lagi DNA sampah

Ketika genom manusia diurutkan, ditemukan bahwa persentase DNA yang terkandung dalam sel tidak mengkode protein (hanya 1,5% yang melakukannya!). DNA ini, yang fungsinya tidak diketahui, disebut DNA sampah. Kemudian diperlakukan agak lebih baik dengan menyebutnya non-coding DNA, karena mulai terlihat bahwa itu berisi urutan yang, meskipun tidak mengkode protein, dapat memiliki beberapa jenis struktural atau fungsi lainnya, seperti pengkodean DNA untuk menyalin. RNA ribosomal atau RNA transfer. Baca lebih lanjut tentang apa yang ada dalam genom manusia di sini dan tentang DNA non-coding di sini.

Mempelajari urutan ini mengungkapkan pentingnya beberapa daerah sementara yang lain mengejutkan para peneliti. Urutan ini ketika dipelajari secara mendalam tidak menyerupai urutan hewan apa pun, meskipun ditemukan pada kerabat dekat manusia, tetapi merupakan urutan virus, yang telah dimasukkan ke dalam genom manusia ribuan tahun yang lalu.

Saat ini diperkirakan sekitar 10% dari genom manusia dilapisi dengan urutan dari retrovirus, seperti HIV, yang mampu memasuki genom manusia. Namun, virus yang telah bersama umat manusia begitu lama tidak aktif. Virus ini menginfeksi nenek moyang manusia jutaan tahun yang lalu. Seiring waktu, urutan virus ini bermutasi sampai tidak aktif, mereka kehilangan kemampuan untuk bereplikasi atau bergerak dalam genom. Setelah dilumpuhkan dan karena mereka tidak tunduk pada jenis tekanan evolusi apa pun untuk tetap tanpa mutasi, karena mereka tidak diperlukan untuk kelangsungan hidup makhluk hidup, mereka mulai memperoleh mutasi dan memvariasikan urutannya. Dengan cara ini, mutasi berbeda yang dihitung oleh urutan ini, serta jumlah atau urutannya, dapat membantu menetapkan garis keturunan antara kelompok manusia dan hewan terkait.

Yang mengganggu, penelitian paling cararn menunjukkan bahwa retrovirus genom fosil ini mungkin tidak lembam seperti yang diperkirakan sebelumnya. Transkripsi DNA ini menjadi RNA telah terlihat terjadi dan mungkin terkait dengan pembungkaman beberapa gen manusia. Tidak diketahui apakah fungsi ini diperoleh, karena mutasi, atau merupakan karakteristik dari retrovirus dan masih dipertahankan. Bagaimanapun, gen yang terpengaruh oleh pembungkaman atau aktivasi ini harus ditemukan seiring waktu.

Saat ini, penelitian tentang melanoma (“Peran retrovirus endogen dalam melanoma kulit” yang diterbitkan pada 2013) telah menunjukkan bahwa dalam menghadapi perubahan genetik, seperti yang menyebabkan kanker, ada kemungkinan beberapa retrovirus diaktifkan, memperburuk penyakit. Lebih lanjut, penelitian yang lebih baru menunjukkan bahwa selama perkembangan otak terdapat jaringan pengatur berdasarkan retrovirus endogen spesifik primata, yang dapat mencakup sekitar 10.000 virus. Jaringan aktivasi ini dapat dikaitkan dengan protein penekan yang berpartisipasi dalam kontrol ekspresi genetik dari urutan pengkodean protein yang khas dari perkembangan otak. (“TRIM28 Mengontrol Jaringan Pengatur Gen Berdasarkan Retrovirus Endogen dalam Sel Progenitor Saraf Manusia” diterbitkan dalam Laporan Sel pada Januari 2017).