Situs aktif

Situs aktif enzim, juga disebut pusat aktif, adalah area enzim tempat substrat mengikat, agar reaksi terjadi.

Enzim adalah protein. Karakteristik tertentu dalam struktur tersiernya adalah yang menentukan bentuk situs aktif enzim, dan oleh karena itu menentukan substrat tempat enzim dapat bertindak. Dengan kata lain, struktur tiga dimensi enzim juga menentukan struktur situs aktif, dan memberikan spesifisitas pada enzim, yang hanya dapat bekerja pada substrat tertentu: substrat yang mampu mengikat situs aktifnya. 

Sering kali, situs aktif berupa celah atau rongga dalam struktur enzim. Sisi aktif biasanya terdiri dari rantai samping residu spesifik, dan karena alasan inilah sering kali memiliki struktur tiga dimensi yang berbeda dari bagian enzim lainnya. Struktur dan komposisi pusat aktif dikonfigurasi sehingga hanya substrat tertentu yang memiliki afinitas yang cukup untuk mengikat area enzim ini.

Pada gambar di atas, panah merah di sebelah kiri menunjukkan situs aktif enzim, yang diwakili dengan warna kuning. Di sebelah kanan, panah menunjuk ke situs aktif yang ditempati oleh substrat. 

Sebagian besar enzim adalah protein globular, dengan ukuran yang sangat bervariasi, yang dapat berkisar dari 62 hingga 2500 asam amino. Dalam kebanyakan kasus, enzim jauh lebih besar daripada substrat tempat mereka bekerja. Hanya sebagian kecil dari enzim yang merupakan situs aktifnya, hanya tiga atau empat asam amino yang bertindak langsung dalam katalisis. 

Enzim juga dapat memiliki situs pengikatan kofaktor, berkali-kali diperlukan untuk reaksi katalitik, atau untuk mengikat molekul kecil lainnya, misalnya substrat atau produk dari reaksi yang dikatalisis. Pengikatan enzim dengan substrat atau produknya dapat meningkatkan atau menurunkan laju reaksi, sehingga kerja enzim dapat diatur dengan umpan balik positif atau negatif (disebut juga umpan balik) .  

Sisi aktif suatu enzim dapat terdegradasi oleh aksi panas, pH ekstrim atau oleh aksi beberapa zat kimia, karena faktor-faktor ini menyebabkan denaturasi protein, yaitu degradasi struktur tersiernya, dengan konsekuensi deformasi enzimatik. situs aktif.

Mengingat spesifisitas tinggi yang diamati pada sebagian besar enzim, mengenai substrat di mana mereka bertindak, dan mengenai reaksi yang dikatalisisnya, Emil Fischer menyarankan pada tahun 1894 bahwa akan ada komplementaritas geometris antara enzim dan substratnya, sehingga mereka dapat direpresentasikan sebagai sebuah kunci dan gembok, yang sangat cocok satu sama lain. Meskipun caral ini menjelaskan kekhususan kerja enzim, caral ini tidak dapat menjelaskan keadaan transisi yang dicapai enzim.

Pada tahun 1958, Koshland menyarankan bahwa situs aktif enzim dapat sedikit mengubah konformasinya dengan mengikat substrat. Dengan cara ini, enzim dapat melakukan tindakan katalitiknya, setelah produk dilepaskan, dan situs aktif kembali ke konformasi aslinya. Ini adalah proses yang ditunjukkan pada gambar berikut:  

Related Posts