Ini adalah asam ribonukleat yang mentransfer kode genetik yang berasal dari DNA inti sel ke ribosom di sitoplasma.
Apa itu RNA?
Log penelitian RNA cukup pendek. Baru pada paruh pertama abad ke-20 RNA diidentifikasi sebagai makromolekul biologis yang tidak bergantung pada DNA oleh ahli kimia karbohidrat yang giat.
Sejak perbedaan ini dibuat, beberapa kelas RNA telah ditemukan, termasuk: messenger RNA (mRNA), RNA ribosom (rRNA), RNA kecil, RNA mikro, dan RNA noncoding panjang.
Mirip dengan DNA, RNA menghadirkan serangkaian tantangan unik bagi para peneliti, termasuk kerentanan terhadap RNase yang ada di mana-mana, degradasi, dan pemipetan.
Sepupu molekul DNA, RNA memainkan peran penting yang tak terhitung jumlahnya dalam biologi molekuler, termasuk: berfungsi sebagai genom, aktivitas enzimatik, dan berpartisipasi dalam setiap langkah ekspresi gen.
Karena RNA di mana-mana dalam biologi, para ilmuwan telah menginvestasikan waktu dan upaya untuk memahami sifat kimia dan biologinya.
Dalam upaya untuk memahami biologi RNA, para peneliti telah mengembangkan banyak teknik biologi molekuler yang relevan, mulai dari PCR transkripsi balik dan elektroforesis gel agarosa, hingga sekuensing dan mikrostring generasi berikutnya.
Dengan tujuan mecararnisasi dan menyederhanakan analisis RNA dan alur kerja kontrol kualitas, ini menghasilkan berbagai solusi untuk alur kerja RNA.
RNA penting untuk berbagai aplikasi biologi molekuler, termasuk: qPCR, NGS, dan rantai mikro. Pemahaman mendalam tentang biologi RNA memengaruhi berbagai penelitian biologi, mulai dari pertanian dan kedokteran hingga evolusi dan pengeditan genom.
Di mana-mana dalam biologi, RNA sangat penting untuk proses yang beragam dan signifikan dalam biologi molekuler. Dengan demikian, ini adalah makromolekul biologis yang menarik bagi para ilmuwan dari berbagai latar belakang dan minat.
Dasar untuk memahami segala sesuatu mulai dari asal usul kehidupan hingga biologi kanker, banyak aplikasi telah dikembangkan untuk lebih memahami fungsi biologis RNA.
Kegunaan hilir yang canggih, terutama NGS, memerlukan penggunaan RNA dengan kualitas yang memadai untuk memastikan hasil yang andal.
Namun, metode analisis RNA tradisional tidak memiliki kinerja, sensitivitas, dan presisi yang diperlukan untuk menilai dengan percaya diri kesesuaian RNA untuk aplikasi hilir.
Misalnya, elektroforesis gel agarosa RNA adalah solusi throughput rendah yang, selain tidak memiliki kemampuan resolusi dan kuantifikasi yang memadai, juga membosankan dan memakan waktu.
Total RNA dan penentuan kualitas
Penentuan kualitas RNA total sangat penting untuk analisis untai mikro, NGS dan aplikasi lain yang sensitif terhadap degradasi dan kontaminasi oleh RNA.
Metode analisis RNA lama memerlukan konsentrasi input yang tinggi dengan resolusi dan kemampuan kuantifikasi yang terbatas. Dan mereka memberikan kuantifikasi, kualifikasi, dan ukuran total sampel RNA yang unggul.
Untuk membantu penilaian empiris kualitas RNA total, AATI mengembangkan RNA Quality Number (RQN) untuk perangkat lunak analisis data.
Dihitung secara otomatis oleh PROSize untuk setiap sampel RNA total, RQN memperhitungkan beberapa faktor, termasuk rasio puncak ribosom, wilayah kecil RNA, dan resolusi antara puncak. Dilaporkan pada skala 1 hingga 10, nilai yang lebih tinggi menunjukkan sampel RNA total berkualitas lebih tinggi.
Kit Uji RNA Sensitivitas Standar DNF-471 dan Kit Uji RNA Sensitivitas Tinggi DNF-472.
Resolusi pemisahan kit ini memberi para peneliti pandangan yang jelas tentang berbagai profil pemisahan RNA total (Unduh Catatan Kegunaan: “Deteksi degradasi RNA tanaman dengan penganalisis fragmen”).
Messenger RNA (perantara)
Messenger RNA (mRNA), perantara antara DNA dan protein, menarik bagi para peneliti karena menyediakan informasi tentang aktivitas gen.
Pengurutan skala besar mRNA organisme, yang disebut transkriptomik, memungkinkan peneliti untuk menentukan gen dan wilayah genom mana yang aktif dalam kondisi berbeda.
Seperti aplikasi NGS lainnya, analisis QC yang tepat dari asam nukleat mentah memastikan bahwa hanya sampel yang tepat yang diurutkan.
RNA kecil (klasifikasi)
RNA kecil adalah klasifikasi yang luas dan berkembang, yang meliputi: microRNA, siRNA, piRNA, dan snRNA. Analisis RNA kecil seringkali sulit, karena banyak metode analisis tidak memiliki resolusi dan sensitivitas minimal yang diperlukan untuk pemisahan, ukuran, dan kuantifikasi yang akurat.
DNF-470 Small RNA Analysis Kit untuk INFINITY Fragment Analyzer dan Fragment Analyzer memberikan sensitivitas tertinggi, throughput variabel, dan resolusi luar biasa untuk analisis QC RNA ukuran kecil.
RNA FFPE dan analisis yang andal
Analisis QC yang andal dari FFPE RNA sangat penting untuk mendapatkan hasil NGS yang rahasia.
Sampel RNA FFPE menunjukkan tingkat degradasi dan ikatan silang yang lebih tinggi, membatasi penerapan RQN pada sampel ini.
Metrik kualitas DV200 untuk PROSize dikembangkan oleh para ilmuwan Ilumina untuk mengatasi tantangan kontrol kualitas yang unik dari RNA FFPE.
DV200 memberi para peneliti alat yang ampuh untuk menganalisis sampel RNA FFPE yang sesuai untuk NGS dari sampel yang tidak sesuai dengan andal, menghemat waktu dan biaya.