Plasmid Ti

Plasmid Ti adalah plasmid yang menarik secara ilmiah dan biologis. Sebelum melanjutkan, kami sarankan Anda membaca artikel kami tentang plasmid di sini . Plasmid Ti (Ti plasmid atau Tumor inducing plasmid dalam bahasa Inggris) dinamai karena kemampuannya membuat bakteri yang membawanya mampu menginduksi tumor di akar atau batang spesies tanaman tertentu . Untungnya bagi tanaman, plasmid ini ditemukan secara eksklusif pada spesies Agrobacterium tumefaciens (berganti nama menjadi Rhizobium rhizogenes pada tahun 2001 ) dan spesies lain dari genus yang sama. Anda dapat membaca lebih lanjut tentang spesies bakteri penting pertanian dan ilmiah ini di artikel kami di sini .

Urutan daerah gen dalam plasmid

Struktur : Plasmid Ti merupakan plasmid dengan berat molekul tinggi , yang berarti cukup besar jika dibandingkan dengan plasmid lainnya. Meskipun tergantung pada strain, ukurannya bervariasi, ia memiliki ukuran rata-rata lebih dari 200 Kb , yang terbesar adalah 300 Kb. Terlepas dari ukurannya, plasmid Ti berisi informasi dari 196 gen , 195 di antaranya diterjemahkan menjadi protein., hanya 19% dari isinya yang tidak mengkode protein.

196 gen ini termasuk gen virulensi (terletak di wilayah tertentu yang disebut wilayah virulensi ). Daerah lain berisi T-DNA transfer DNA ) yang ditransfer dari bakteri ke sel tumbuhan. Wilayah ini diapit oleh dua sisi, kiri dan kanan, yang terdiri dari 23 hingga 25 nukleotida. T-DNA akan melakukan perjalanan sampai memasuki genom tanaman parasit. T-DNA mengandung gen untuk sintesis, di dalam tanaman, dari satu atau lebih dari setiap jenis protein berikut: auksin, sitokinin, dan opinas . Selain itu, plasmid Ti memiliki daerah pengkode gen untuk katabolisme opin dan asal replikasi , untuk dapat mereplikasi sehingga tidak hilang selama pembelahan sel.

Cara kerjanya : pertama agrobacteria bersentuhan dengan akar tanaman, ketika menangkap molekul fenolik yang dikeluarkan oleh akar. Pada saat ini, sintesis protein dari gen virulensi dirangsang . Gen pertama yang diinduksi adalah Vir-A , yang dengan mengeluarkan ATP merangsang sintesis Vir-G Vir-G bertugas merangsang sintesis sisa gen virulensi Vir-D1 dan Vir-D2 bertanggung jawab untuk memotong T-DNA di tepi kiri dan kanan. Vir-B membentuk pori pada dinding bakteri yang berkomunikasi dengan interior sel tumbuhan, Vir-E , bersama-sama dengan Vir-D1 dan Vir-D2 membentuk kompleks dengan protein lain (VIP) yang akan masuk ke dalam sel tumbuhan. Dalam sitoplasma sel Vir D2 dikenali oleh mekanisme tumbuhan sebagai protein inti dan berjalan ke nukleus menyeret seluruh kompleks. Begitu T-DNA berada di dalam nukleus, ia berintegrasi ke dalam daerah-daerah yang homolog dengan tepinya.

Setelah dalam genom, protein T-DNA mulai disintesis (oleh tanaman), sitokinin dan auksin adalah hormon tanaman (pelajari lebih lanjut tentang mereka di sini dan di sini ) yang merangsang proliferasi sel tanaman yang tidak terkendali , yaitu pembentukan tumor. The opsins yang dihasilkan digunakan oleh agrobacteria sebagai sumber energi .

Penggunaan dalam bioteknologi : jika T-DNA dihilangkan, DNA apa pun yang ingin Anda transfer ke tanaman dapat dimasukkan untuk memperbaikinya atau mempelajari protein yang dikodekannya.

Related Posts