Asam amino adalah asam organik, yang bergabung membentuk protein. Struktur dasar asam amino terdiri dari karbon pusat (alfa), bergabung dengan gugus karboksil (COOH), gugus amino (NH2), hidrogen dan rantai samping R, yang membedakan satu asam amino dari yang lain..
Jika asam amino dalam larutan berair dan pH 7, gugus karboksil dan amino akan terionisasi, yaitu, hidrogen dari gugus karboksil berpindah ke gugus amino, dan sebagai akibatnya akan terbentuk dipol dalam molekul.
Seperti yang telah kita katakan, asam amino berbeda satu sama lain dengan rantai samping R. Menurut komponen rantai ini, kita dapat mengklasifikasikan asam amino sebagai berikut:
Asam amino alifatik
Rantai samping asam amino ini bersifat hidrofobik, itulah sebabnya mereka cenderung berada di dalam protein globular, seperti dalam larutan berair.
– Glisin (Gly; G):. Ia hanya memiliki satu atom hidrogen sebagai rantai sampingnya. Ini adalah asam amino paling sederhana dari semuanya.
– Alanin (Ala; A): Pada rantai sampingnya kita temukan gugus metil.
– Valin (Val; V): Ini lebih hidrofobik daripada yang sebelumnya, mengingat rantai samping hidrokarbonnya lebih panjang dan bercabang.
– Leusin (Leu; L): mirip dengan yang sebelumnya, dengan satu gugus metil lagi.
– Isoleusin (Ile; I): Ini berbeda dari leusin dengan posisi salah satu gugus metil.
– Prolin (Pro; P): rantai sampingnya bergabung dengan karbon pusat dan juga gugus amino, membentuk cincin.
Asam amino aromatik
Di rantai samping asam amino ini kita menemukan cincin aromatik. Inilah sebabnya mengapa mereka sangat hidrofobik.
– Fenilalanin (Phe; F): rantai sampingnya terdiri dari gugus metil dan cincin benzena di ujungnya.
– Tirosin (Tyr; Y): sama seperti yang sebelumnya tetapi dengan gugus hidroksil di ujungnya, yang memberikan hidrofilisitas tertentu.
– Triptofan (Trp; W): kami mengamati cincin indol antara cincin benzena dan gugus metil. Sangat hidrofobik.
Asam amino belerang
– Sistein (Cys; C): pada rantai sampingnya kita temukan gugus sulfhidril (-SH). Gugus ini sangat reaktif dan membentuk ikatan hidrogen dan ikatan disulfida (SS; ikatan kovalen)
Pada gambar di atas kita melihat dua sistein dihubungkan oleh ikatan disulfida, asam amino yang dihasilkan disebut sistin.
– Metionin (Met; M): Semua proses transkripsi protein dimulai dengan asam amino ini. Gugus sulfhidrilnya tidak reaktif seperti asam amino sebelumnya.
Asam amino hidrofilik
Dalam kelompok ini kita dapat menemukan tiga subkelompok: asam amino asam, basa dan netral.
Asam amino asam : mereka sangat polar dan berkat gugus asam yang dapat kita temukan di rantai sampingnya, mereka memiliki muatan negatif pada pH netral.
– Asam aspartat (Asp; D): disebut juga aspartat, karena pada pH fisiologis ia terdisosiasi, karena gugus karboksil kehilangan hidrogen.
– Asam glutamat (Glu; E): juga dikenal dengan nama glutamat, untuk alasan yang sama seperti yang sebelumnya.
Asam amino dasar : di rantai sampingnya kita menemukan gugus amino, yang akan bermuatan positif pada pH netral.
– Lisin (Lys; K): Rantai sampingnya panjang. Meskipun mungkin terlihat seperti rantai hidrofobik, polaritasnya diberikan oleh gugus amino terminal.
– Arginin (Arg; R): mengandung rantai samping terpanjang, dengan gugus guanidino di ujungnya.
Asam amino netral : kami tidak menemukan gugus amino atau gugus karboksil dalam rantai R-nya, oleh karena itu mereka tidak memiliki muatan pada pH netral. Namun mereka bersifat polar, dan dapat membentuk ikatan hidrogen.
– Serin (Ser; S): Memiliki gugus OH di ujung rantai R-nya.
– Treonin (Thr; T): Ia juga memiliki Gugus OH dalam rantai R-nya.
– Glutamin (Gln; Q): memiliki gugus amino dan karbonil di ujung rantainya.