Transposon

Ini didefinisikan sebagai transposon ke urutan DNA yang dapat dimobilisasi dalam genom . Protein yang bertanggung jawab untuk transposisi dan integrasi dalam genom disebut transposase. Protein ini dapat dikodekan di dalam unsur transposable atau di luarnya. Oleh karena itu transposon adalah contoh khas dari unsur genetik bergerak.

Lompatan transposon dalam gen untuk pewarnaan biji jagung merupakan teka-teki sampai Barbara McClintock mengusulkan keberadaan transposon.

Transposon ditemukan di semua organisme dan merupakan sumber variasi dan mutasi. Mereka dianggap sebagai unsur kunci dalam evolusi genom eukariotik. Pada suatu waktu Anda dianggap sampah dan DNA berbahaya karena melompat menyeret DNA dari genom inang.

Saat ini ada teori yang berbeda tentang fungsi unsur-unsur ini karena mereka sangat melimpah (sekitar 50% dari genom manusia dan hingga 80% di beberapa tanaman) dan telah terlihat bahwa mereka adalah sumber mutasi yang harus diperhitungkan., seperti yang ditemukan dan didemonstrasikan oleh Bárbara McClintock dalam eksperimennya pada jagung (pada 1950-an), di mana ia memenangkan Hadiah Nobel dalam bidang kedokteran dan fisiologi saja pada tahun 1983 ketika eksperimennya dipahami.

Transposon, tergantung pada mekanisme transposisi, terdiri dari 2 jenis:

– Kelas I: atau unsur retro , adalah transposon yang untuk mobilisasi memerlukan sintesis RNA perantara yang akan ditranskripsikan kembali ke cDNA dan disisipkan pada titik lain dalam genom. Elemen bergerak ini mungkin atau mungkin tidak memiliki LTR (urutan berulang terminal panjang). Contoh paling umum adalah LINES (unsur diselingi panjang). Ini transposisi replikatif (copy & paste) selalu mengarah ke peningkatan jumlah salinan dan lead ini untuk mutasi stabil. Tergantung pada situs penyisipan, mereka mungkin atau mungkin tidak mempengaruhi fenotipe. Elemen SOLO LTR juga dapat dihasilkan dengan rekombinasi homolog.

Non-LTR tidak memiliki pengulangan di ujungnya. Pada 3′ ada daerah polyA. Awal transkripsi ditandai oleh 5 ‘unsur, seperti SINES (unsur diselingi pendek), yang membutuhkan kehadiran protein dari unsur lain untuk transpos.

Transposisi non-replikatif lebih sering terjadi, sehingga jumlah salinannya rendah (kecuali MITE). Replikasi telah diamati berfungsi seperti replikasi lingkaran bergulir bakteri.

– Kelas II: transposon itu sendiri. Di dalamnya, transposisi bersifat non-replikatif (potong & tempel), transposase memotong urutan DNA dan transposase yang sama atau enzim lain memasukkannya ke posisi lain.

Di kedua kelas ada unsur:

– Otonom: mereka memiliki informasi untuk protein tertentu, atau beberapa, yang terlibat dalam mobilisasi mereka sendiri. gen ORF dan Transposase.

– Non-otonom: karena mutasi mereka kehilangan ORF sehingga Transposase tidak dapat disintesis.

Ketika spesies dekat dibandingkan tetapi dengan ukuran genom dan jumlah transposon yang berbeda, sintesis gen diamati (gen yang sama dan urutan yang sama), tetapi jumlah unsur bergerak bervariasi.

– Contoh: jagung dan sorgum. 10 kromosom, sythenia, menyimpang 15 juta tahun yang lalu. Genom jagung 4 kali lebih besar. Analisis urutan menentukan bahwa ekspansi disebabkan oleh retrotransposisi; bahkan unsur retro yang disisipkan ke unsur retro lainnya.

Dengan menganalisis LTR, usia retrotransposon dan hubungannya dengan tingkat mutasi dapat diperkirakan.

Related Posts